RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355904.8

GTF2E2-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E2, Length 1,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2-201ENST00000355904 FKRPQ9H9S5 495 aa22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 SH2D2AQ9NP31 389 aa22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF229Q9UJW7 825 aa22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 HIF3AQ9Y2N7 669 aa22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa22.11■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 A8MVM7 634 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 MCIDASD6RGH6 385 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 CDH11P55287 796 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 GPR107Q5VW38 600 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 CPOQ8IVL8 374 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 SIRT6Q8N6T7 355 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 OR2M3Q8NG83 312 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 STK35Q8TDR2 534 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 PAQR8Q8TEZ7 354 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 TMEM80Q96HE8 168 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 FRMD6Q96NE9 622 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 TAPBPLQ9BX59 468 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 CHRNA9Q9UGM1 479 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 VDAC3Q9Y277 283 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF292O60281 2723 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 NPIPB7O75200 414 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 BGLAPP02818 100 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 LCKP06239 509 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ADRA2AP08913 450 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 CCL3P10147 92 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 HK1P19367 917 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 DCKP27707 260 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 PSMB9P28065 219 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 NOS3P29474 1203 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 RPL4P36578 427 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 FOXF1Q12946 379 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ANKDD1AQ495B1 522 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 C5orf46Q6UWT4 87 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 IGFN1Q86VF2 1251 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 GID4Q8IVV7 300 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 BBS1Q8NFJ9 593 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 RNFT2Q96EX2 444 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 PTDSS2Q9BVG9 487 aa22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 IRGMA1A4Y4 181 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF3P17036 446 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 MTNR1AP48039 350 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 PLPPR5Q32ZL2 321 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 C1orf140Q5VVS0 124 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 PLBD1Q6P4A8 553 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 DTX1Q86Y01 620 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 FADS6Q8N9I5 356 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 OR4K17Q8NGC6 315 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 MOSPD2Q8NHP6 518 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ISOC1Q96CN7 298 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 IP6K3Q96PC2 410 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ANGPTL4Q9BY76 406 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 TAS2R16Q9NYV7 291 aa22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 PCNX3Q9H6A9 2034 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 FAM183AA6NL82 134 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 MT-ATP6P00846 226 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 IFNGP01579 166 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ADORA3P0DMS8 318 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 UQCRC1P31930 480 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 KLHL22Q53GT1 634 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 SLC25A53Q5H9E4 307 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ACER2Q5QJU3 275 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 C1QL3Q5VWW1 255 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 SLC22A10Q63ZE4 541 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 WDSUB1Q8N9V3 476 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 OR52I1Q8NGK6 324 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 LGALS12Q96DT0 336 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 NPAS1Q99742 590 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 ASCL3Q9NQ33 180 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 FBXL2Q9UKC9 423 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa22.08■■□□□ 1.13
GTF2E2-201ENST00000355904 MPDZO75970 2070 aa22.08■■□□□ 1.12
GTF2E2-201ENST00000355904 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2-201ENST00000355904 PTHP01270 115 aa22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2-201ENST00000355904 HIST1H2ABP04908 130 aa22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2-201ENST00000355904 ACVR2AP27037 513 aa22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2-201ENST00000355904 HTR1FP30939 366 aa22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2-201ENST00000355904 AQP2P41181 271 aa22.07■■□□□ 1.12
GTF2E2-201ENST00000355904 RAB40BQ12829 278 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms