RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 CD82P27701 267 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 GRK5P34947 590 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 DLSTP36957 453 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT6P53370 316 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 LIMK1P53667 647 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB39AQ14964 217 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 QPRTQ15274 297 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 COL28A1Q2UY09 1125 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 XAF1Q6GPH4 301 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB43Q86YS6 212 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8D4Q8NGM9 314 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 LIPHQ8WWY8 451 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB15Q8WXK1 588 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ST8SIA1Q92185 356 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SGCDQ92629 289 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM80Q96HE8 168 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RTN4RQ9BZR6 473 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 FN3KQ9H479 309 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 CDCP1Q9H5V8 836 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 NANSQ9NR45 359 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR83Q9NYM4 423 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXJ2Q9P0K8 574 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 OSGIN1Q9UJX0 560 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ERGIC3Q9Y282 383 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV27A0A087WT01 109 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PMS2P1A4D2B8 440 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RIIAD1A6NNX1 92 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MVM7 634 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R129 80 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SURF4O15260 269 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2T1O43869 369 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 GMFGO60234 142 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RAD1O60671 282 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 TRMUO75648 421 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 OR7A10O76100 309 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 MT-ND2P03891 347 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINA7P05543 415 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 STSP08842 583 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 CEACAM1P13688 526 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PCMT1P22061 227 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 DCKP27707 260 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC15A1P46059 708 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 MLF1P58340 268 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SYT14P1Q58G82 188 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A10Q63ZE4 541 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 IL20RBQ6UXL0 311 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 AMER2Q8N7J2 671 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 MUL1Q969V5 352 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SGCZQ96LD1 299 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 LHPPQ9H008 270 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 CPNE5Q9HCH3 593 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 MED11Q9P086 117 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 IL20RAQ9UHF4 553 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 USP34Q70CQ2 3546 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 BHLHE40O14503 412 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC14L2O76054 403 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.2 ms