RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299339.2

CLDN10-201, Transcript of claudin 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN10, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10-201ENST00000299339 NACC2Q96BF6 587 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 GIMAP5Q96F15 307 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 PRRC1Q96M27 445 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 Q96MT0 163 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 COL21A1Q96P44 957 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 FUZQ9BT04 418 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 YIPF3Q9GZM5 350 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 RACGAP1Q9H0H5 632 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 SLC38A1Q9H2H9 487 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 GPR160Q9UJ42 338 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 SLC13A4Q9UKG4 626 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 CDC14AQ9UNH5 594 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CLDN10-201ENST00000299339 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 A0A0G2JN53 185 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 IRGMA1A4Y4 181 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 SH3PXD2BA1X283 911 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 SNTNA6NMZ2 147 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 ZAR1LA6NP61 321 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 C4orf51C9J302 202 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 FAM227AF5H4B4 570 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 AP3D1O14617 1153 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 PSPNO60542 156 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 STX11O75558 287 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 CLIC3O95833 236 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 IFNA2P01563 188 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 ALOX5P09917 674 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 PIPP12273 146 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 ELK4P28324 431 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 CHRNB4P30926 498 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 LCN1P31025 176 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 KRT20P35900 424 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 OR1E2P47887 323 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 AVPR1BP47901 424 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 CRISP1P54107 249 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 PRKAG1P54619 331 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 CDH12P55289 794 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 HSD17B7P56937 341 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 PSPHP78330 225 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 DCDP81605 110 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 HPCAP84074 193 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 GRM7Q14831 915 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 TRAM2Q15035 370 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 SYPL1Q16563 259 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 MEP1AQ16819 746 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 TMEM44Q2T9K0 475 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 GPAT3Q53EU6 434 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 KRTCAP3Q53RY4 240 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 MEDAGQ5VYS4 303 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 RNLSQ5VYX0 342 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 C16orf62Q7Z3J2 963 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 CMIPQ8IY22 773 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 OR4N4Q8N0Y3 316 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 CA13Q8N1Q1 262 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 SMYD1Q8NB12 490 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 OR9A2Q8NGT5 310 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 SLC35A4Q96G79 324 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 SDF2Q99470 211 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 ARHGDIGQ99819 225 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 FNDC11Q9BVV2 318 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 TEX12Q9BXU0 123 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 PRRG3Q9BZD7 231 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 SERHL2Q9H4I8 314 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 PCDHB10Q9UN67 800 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 A4GNTQ9UNA3 340 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 RNF6Q9Y252 685 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 MMACHCQ9Y4U1 282 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.96□□□□□ -1.46
CLDN10-201ENST00000299339 ARID1AO14497 2285 aa5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms