RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 FKRPQ9H9S5 495 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A19Q9HC21 320 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 B4GALT7Q9UBV7 327 aa18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2T1O43869 369 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 MT-ATP6P00846 226 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF17P17021 662 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ELK4P28324 431 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFSF10P50591 281 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 CDK5Q00535 292 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 TLE3Q04726 772 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 GINS1Q14691 196 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 CASP12Q6UXS9 341 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC17Q8N6Y2 441 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM178AQ8NBL3 297 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 OR5M1Q8NGP8 315 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 SAMD8Q96LT4 415 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 MOGAT1Q96PD6 335 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 TEX12Q9BXU0 123 aa18.73■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ZIC3O60481 467 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 PTP4A3O75365 173 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 GDF1P27539 372 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 FXYD6P3P58550 94 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXK1P85037 733 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 CD47Q08722 323 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 SYT14P1Q58G82 188 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF766Q5HY98 468 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 C1QL3Q5VWW1 255 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC43A2Q8N370 569 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2T33Q8NG76 320 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 SCMH1Q96GD3 660 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 PTDSS2Q9BVG9 487 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 PRRG3Q9BZD7 231 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 MCCC2Q9HCC0 563 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 IL20RAQ9UHF4 553 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF229Q9UJW7 825 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 H3BML4 177 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 RFPL3SP0C7P2 107 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ASAH2BP0C7U1 165 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 IL11P20809 199 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 LTBQ06643 244 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM44Q2T9K0 475 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 C12orf73Q69YU5 71 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ENTHD1Q8IYW4 607 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF786Q8N393 782 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 PIGQQ9BRB3 760 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 RASSF1Q9NS23 344 aa18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 URB1O60287 2271 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 NCKAP5O14513 1909 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 EFNA2O43921 213 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 NDUFB2O95178 105 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 BGLAPP02818 100 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 TFPIP10646 304 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 MYBPC1Q00872 1141 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 FHL1Q13642 323 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKDD1AQ495B1 522 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 OR6S1Q8NH40 331 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 OR14L1PQ8NHC6 308 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 FBLIM1Q8WUP2 373 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 TM9SF4Q92544 642 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 POTEKPQ9BYX7 375 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ADNPQ9H2P0 1102 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF6Q9Y252 685 aa18.71■□□□□ 0.59
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2M5A3KFT3 312 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 MPZL2O60487 215 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAPPC6AO75865 159 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFAIP8O95379 198 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2ABP04908 130 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 PEPDP12955 493 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC6A6P31641 620 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 MEOX1P50221 254 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 PRPS1P60891 318 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 PGGHGQ32M88 737 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2ACQ93077 130 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2FQ969M7 185 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A36Q96CQ1 311 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJA3Q96EY1 480 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 ARL5BQ96KC2 179 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC38A2Q96QD8 506 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 TTTY12Q9BZ98 90 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM185BQ9H7F4 350 aa18.7■□□□□ 0.58
PACSIN3-201ENST00000298838 HIF3AQ9Y2N7 669 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms