RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295767.9

CHCHD4-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-201ENST00000295767 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 NRMQ8IXM6 262 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 OR4K5Q8NGD3 323 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 OR10D3Q8NH80 312 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 OR2V1Q8NHB1 315 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 TAAR8Q969N4 342 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 C20orf141Q9NUB4 165 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 TMCC3Q9ULS5 477 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 DIO1P49895 249 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 GXYLT1Q4G148 440 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 TMPPEQ6ZT21 453 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 PM20D2Q8IYS1 436 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM57AQ8TBR7 257 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 MIB2Q96AX9 1013 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM208BQ5VWN6 2430 aa24.89■■□□□ 1.58
CHCHD4-201ENST00000295767 ENO4A6NNW6 628 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 SULT2B1O00204 365 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 TPOP07202 933 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 TLE1Q04724 770 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 EMC4Q5J8M3 183 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM69AQ5T7M9 428 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 RRM2BQ7LG56 351 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 BDH2Q9BUT1 245 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 KLHL4Q9C0H6 718 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF835Q9Y2P0 537 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 LRRN3E7EW58 273 aa24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CXCL13O43927 109 aa24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 E2F6O75461 281 aa24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 PMS2P2O95744 297 aa24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 PDSS1Q5T2R2 415 aa24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CD163Q86VB7 1156 aa24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 OSTF1Q92882 214 aa24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 TUBA1CQ9BQE3 449 aa24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 SRXN1Q9BYN0 137 aa24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CFAP46Q8IYW2 2715 aa24.88■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 LIPT2A6NK58 231 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 FTCDNL1E5RQL4 147 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 SLC19A2O60779 497 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 BGLAPP02818 100 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 IFI30P13284 250 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 FPR1P21462 350 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CARD18P57730 90 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 PRKCDQ05655 676 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 RBPJQ06330 500 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 LTBQ06643 244 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 GK3PQ14409 553 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 RCN1Q15293 331 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 OR7A5Q15622 319 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 MFSD8Q8NHS3 518 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 SLC25A36Q96CQ1 311 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 MOGAT1Q96PD6 335 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 ALKBH4Q9NXW9 302 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 TRAPPC4Q9Y296 219 aa24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 OR10H3O60404 316 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CCNB2O95067 398 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 IGF2P01344 180 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 OR2B6P58173 313 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF585AQ6P3V2 769 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 PQLC1Q8N2U9 271 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 C10orf53Q8N6V4 93 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 OR9Q2Q8NGE9 314 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 BPIFA2Q96DR5 249 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 TAPBPLQ9BX59 468 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 OR2T1O43869 369 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 BAG2O95816 211 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CH25HO95992 272 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CBLP22681 906 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CTBP2P56545 445 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 RAC3P60763 192 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 SGCBQ16585 318 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF74Q16587 644 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 MICAQ29983 383 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 HS3ST5Q8IZT8 346 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 OR6S1Q8NH40 331 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 PIGXQ8TBF5 258 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 SGTBQ96EQ0 304 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CHD6Q8TD26 2715 aa24.85■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 OMPP47874 163 aa24.85■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 PLXDC2Q6UX71 529 aa24.85■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CHMP1BQ7LBR1 199 aa24.85■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 ZPLD1Q8TCW7 415 aa24.85■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CHCHD4-201ENST00000295767 CLCA1A8K7I4 914 aa24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms