RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 MED13Q9UHV7 2174 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV27A0A087WT01 109 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 G3V3Y1 287 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 M0R129 80 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 MPZL2O60487 215 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 NEURL1O76050 574 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 MASP1P48740 699 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCR4P61073 352 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TEKQ02763 1124 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC20Q12834 499 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TIGD3Q6B0B8 471 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC103Q8IW40 242 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC17Q8N6Y2 441 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1J4Q8NGS1 313 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4Q3Q8NH05 313 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51A7Q8NH64 312 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 POC1BQ8TC44 478 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ENKD1Q9H0I2 346 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 POLHQ9Y253 713 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF337Q9Y3M9 751 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 A8MVM7 634 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC1A7O00341 560 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A12O75746 678 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 WDPCPO95876 746 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 F10P00742 488 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM18P0DKX4 95 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 BMP7P18075 431 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CRHBPP24387 322 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 EFNB1P98172 346 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 LTBQ06643 244 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 BLMHQ13867 455 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SPINK14Q6IE38 97 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00696Q6ZRV3 163 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 PTCHD4Q6ZW05 846 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 STK35Q8TDR2 534 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNE4Q8WWG9 221 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TAAR8Q969N4 342 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 MCCC2Q9HCC0 563 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TVP23BQ9NYZ1 205 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 IL20RAQ9UHF4 553 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087WZY1 265 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC159P0C7I6 412 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 FMO3P31513 532 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 DNASE1L1P49184 302 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 C5orf46Q6UWT4 87 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 THSD4Q6ZMP0 1018 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC43A2Q8N370 569 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2T33Q8NG76 320 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52L1Q8NGH7 329 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 AGAP4Q96P64 663 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 GNRHR2Q96P88 292 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 MOGAT1Q96PD6 335 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 UBQLN3Q9H347 655 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR83Q9NYM4 423 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRNA9Q9UGM1 479 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0G2JMM0 328 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PPB8 328 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PRS3 328 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 A6NL46 340 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 KIR3DP1A8MWS1 328 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CNR1P21554 472 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS5P46782 204 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 PCYT1AP49585 367 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP2K6P52564 334 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 PGGHGQ32M88 737 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QL3Q5VWW1 255 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF248Q8NDW4 579 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN14Q8NG11 270 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8J1Q8NGP2 316 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB8AQ96BR9 441 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 PTDSS2Q9BVG9 487 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 NANSQ9NR45 359 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 DEPPQ9NTK1 212 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 MSRB2Q9Y3D2 182 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 MPDZO75970 2070 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SHISA8B8ZZ34 492 aa22.52■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 BHLHE40O14503 412 aa22.52■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 EFSO43281 561 aa22.52■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF208O43345 1280 aa22.52■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 CBR3O75828 277 aa22.52■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 BGLAPP02818 100 aa22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms