RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	IDS	B3KWA1	339 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PDCD5	O14737	125 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PHYH	O14832	338 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CHST10	O43529	356 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GMFG	O60234	142 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NPHS1	O60500	1241 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	HPGDS	O60760	199 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	EED	O75530	441 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LAP3	P28838	519 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC1A3	P43003	542 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	AVPR1B	P47901	424 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC6A12	P48065	614 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF81	P51508	661 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ERVK-25	P63136	954 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MC1R	Q01726	317 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LCP2	Q13094	533 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CLN3	Q13286	438 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFA9	Q16795	377 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	AARD	Q4LEZ3	155 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	C18orf63	Q68DL7	685 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CLEC14A	Q86T13	490 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495		Q96MT0	163 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PFDN5	Q99471	154 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OPA3	Q9H6K4	179 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CRLF2	Q9HC73	371 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TREM2	Q9NZC2	230 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF225	Q9UK10	706 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SSR3	Q9UNL2	185 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R233	179 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	STX11	O75558	287 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CSF3	P09919	207 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LIPC	P11150	499 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	HTR1E	P28566	365 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CD96	P40200	585 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKAG1	P54619	331 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXC5	Q00444	222 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TLE3	Q04726	772 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC3A1	Q07837	685 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	IL10RA	Q13651	578 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SSX3	Q99909	188 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZPBP	Q9BS86	351 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GVI7	797 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R082	166 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PIP5K1B	O14986	540 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PLA2G10	O15496	165 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CHP2	O43745	196 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	APOC3	P02656	99 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC6A2	P23975	617 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FMO3	P31513	532 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FOLR3	P41439	243 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GSK3B	P49841	420 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	EMP2	P54851	167 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ATRAID	Q6UW56	229 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ABHD13	Q7L211	337 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	STPG2	Q8N412	459 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	APIP	Q96GX9	242 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SEPHS2	Q99611	448 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MED28	Q9H204	178 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		6.67	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	STUB1	Q9UNE7	303 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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