RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC17A5Q9NRA2 495 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A10Q9NS82 523 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-211ENST00000590874 GUSBP08236 651 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CSF3P09919 207 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINB5P36952 375 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 EMX2Q04743 252 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf78Q8N4C9 275 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 TCP10LQ8TDR4 215 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 OIT3Q8WWZ8 545 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ROPN1LQ96C74 230 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SAP130Q9H0E3 1048 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 FKRPQ9H9S5 495 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 POLE3Q9NRF9 147 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ASIC5Q9NY37 505 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM181Q9P2C4 612 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 DCTN4Q9UJW0 460 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 AP3D1O14617 1153 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 LMX1BO60663 402 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFBP5P24593 272 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 IDH2P48735 452 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CLK1P49759 484 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PHC1P78364 1004 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNB3Q05901 458 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ATAD3BQ5T9A4 648 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPO2Q5TGU0 170 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 IL17RELQ6ZVW7 336 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD46Q86W74 232 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 UPB1Q9UBR1 384 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC4Q9Y296 219 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 AMDHD2Q9Y303 409 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCE1Q9P212 2302 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SCN2BO60939 215 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 AGR2O95994 175 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 IMPDH2P12268 514 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 BMP4P12644 408 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ10P78508 379 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 MST1LQ2TV78 715 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8J2Q8NGG1 315 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM72A0PK05 275 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35F4A4IF30 521 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 VWC2LB2RUY7 222 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QCP02747 245 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC17A1Q14916 467 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SAXO2Q658L1 398 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf24Q9BVV8 132 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CHODLQ9H9P2 273 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 OSGIN1Q9UJX0 560 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 MOKQ9UQ07 419 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 TMED7Q9Y3B3 224 aa22.42■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SRD5A1P18405 259 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 UQCRC2P22695 453 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 THBS2P35442 1172 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 GZMKP49863 264 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35A1P78382 337 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 GGTLC2Q14390 218 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SWI5Q1ZZU3 235 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO17Q96EF6 278 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SORCS2Q96PQ0 1159 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PARPBPQ9NWS1 579 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 SVEP1Q4LDE5 3571 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 BPGMP07738 259 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 KHKP50053 298 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 GPAT3Q53EU6 434 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 DDIT4LQ96D03 193 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR14Q9BWN1 585 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNS2Q9ULS6 477 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF208O43345 1280 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CREB1P16220 341 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TACR3P29371 465 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MPGP29372 298 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 NR4A2P43354 598 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR3AP46098 478 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PDLIM4P50479 330 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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