RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	GRINA	Q7Z429	371 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	ST8SIA1	Q92185	356 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	SGCD	Q92629	289 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	SURF4	O15260	269 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	MT-ND2	P03891	347 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	SERPINA7	P05543	415 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	CELA2A	P08217	269 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	HTR1A	P08908	422 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	NOS3	P29474	1203 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	MLF1	P58340	268 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	EFNB1	P98172	346 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	ST3GAL4	Q11206	333 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	RAB39A	Q14964	217 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	RNF138	Q8WVD3	245 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	FCGR1B	Q92637	280 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	NANS	Q9NR45	359 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	GPR83	Q9NYM4	423 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	IFNG	P01579	166 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	CASP3	P42574	277 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	CHAF1B	Q13112	559 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	LNX2	Q8N448	690 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	FN3K	Q9H479	309 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	HPF1	Q9NWY4	346 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	C2orf72	A6NCS6	295 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610		H3BSA7	217 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	BHLHE40	O14503	412 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	PRODH	O43272	600 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	STS	P08842	583 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	HK1	P19367	917 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	CCNA2	P20248	432 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	PCMT1	P22061	227 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	GAS1	P54826	345 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	SYT14P1	Q58G82	188 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	XAF1	Q6GPH4	301 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	LIPH	Q8WWY8	451 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	CRELD1	Q96HD1	420 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM80	Q96HE8	168 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	MED11	Q9P086	117 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	ITPR1	Q14643	2758 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610		A8MVM7	634 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	MAN1A2	O60476	641 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ATG13-222	ENST00000534610	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17

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