RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	PRSS50	Q9UI38	385 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	F8	P00451	2351 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM72	A0PK05	275 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	ADAM11	O75078	769 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	LYZL6	O75951	148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	FOSL1	P15407	271 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	IDUA	P35475	653 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	PLAUR	Q03405	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	TSC22D1	Q15714	1073 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	TAB1	Q15750	504 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	STK11	Q15831	433 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	BBS10	Q8TAM1	723 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	MUCL1	Q96DR8	90 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	SPG11	Q96JI7	2443 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	CIB4	A0PJX0	185 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF716	A6NP11	495 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	GPI	P06744	558 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	CD3E	P07766	207 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	GKN3P	P0CG01	181 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	GGT1	P19440	569 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	HOXC12	P31275	282 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	ATP4B	P51164	291 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC16A1	P53985	500 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	SQLE	Q14534	574 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	MAPK11	Q15759	364 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	KRT73	Q86Y46	540 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	MAGEB18	Q96M61	343 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	ADAM19	Q9H013	955 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	ASB6	Q9NWX5	421 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBBP4-215	ENST00000524393	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393		A8MVM7	634 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	EVPLL	A8MZ36	301 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	HS3ST1	O14792	307 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	CLOCK	O15516	846 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TMCC2	O75069	709 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	BMP2	P12643	396 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	COX5A	P20674	150 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PPA1	Q15181	289 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	AGK	Q53H12	422 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393		Q5PR19	223 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	CASP12	Q6UXS9	341 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC103	Q8IW40	242 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF611	Q8N823	705 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	MAL2	Q969L2	176 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC35B4	Q969S0	331 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PERP	Q96FX8	193 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	UPB1	Q9UBR1	384 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	MED13L	Q71F56	2210 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	PGM3	O95394	542 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	IGHV3-9	P01782	118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	NUDT7	P0C024	238 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	IMPDH2	P12268	514 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	ETS2	P15036	469 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	IGHV1-2	P23083	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBBP4-215	ENST00000524393	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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