RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519813.1

TMPRSS4-208, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMPRSS4, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-208ENST00000519813 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 HMGB4Q8WW32 186 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 THAP4Q8WY91 577 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC7A6Q92536 515 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 GHSRQ92847 366 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 NACC2Q96BF6 587 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 MED30Q96HR3 178 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 RADILQ96JH8 1075 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 HYLS1Q96M11 299 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 TIMP4Q99727 224 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 GDF15Q99988 308 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 IER2Q9BTL4 223 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 PRR14Q9BWN1 585 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 ADAM19Q9H013 955 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 FKRPQ9H9S5 495 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.69□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 BPTFQ12830 3046 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 A0A1W2PR77 199 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 TTLL8A6PVC2 850 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 J3QLW9 94 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZNF264O43296 627 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 OR2T1O43869 369 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 PIP5K1CO60331 668 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 HPGDSO60760 199 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 PRAF2O60831 178 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 FZD7O75084 574 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 RDH16O75452 317 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC2A10O95528 541 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 LALBAP00709 142 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 RENP00797 406 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 STATHP02808 62 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 FAM157BP0CG42 384 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 CHRNB1P11230 501 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 PNLIPP16233 465 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZNF19P17023 458 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 NAGAP17050 411 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 PGCP20142 388 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 C4BPBP20851 252 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 ALAS2P22557 587 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 CFPP27918 469 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 CD1CP29017 333 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC6A1P30531 599 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 SDHAP31040 664 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 PYCR1P32322 319 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 KIR2DL3P43628 341 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC16A1P53985 500 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 HSD11B2P80365 405 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 DAB2P98082 770 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 HOXC5Q00444 222 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZNF85Q03923 595 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 MAB21L1Q13394 359 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 TNK1Q13470 666 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 TDGQ13569 410 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 EFR3AQ14156 821 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 CRMP1Q14194 572 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 CDK5R1Q15078 307 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 IDNKQ5T6J7 187 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 FDX2Q6P4F2 183 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 NSMAFQ92636 917 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.68□□□□□ -1.34
TMPRSS4-208ENST00000519813 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms