RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 FBXO8Q9NRD0 319 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 CHRNA9Q9UGM1 479 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 FBXL4Q9UKA2 621 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa15.99■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 METTL15A6NJ78 407 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 SCO2O43819 266 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ONECUT2O95948 504 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 EVI2BP34910 448 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 IDUAP35475 653 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ACBD7Q8N6N7 88 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 AGBL5Q8NDL9 886 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 UFD1Q92890 307 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 SPSB2Q99619 263 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF649Q9BS31 505 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM43Q9BTV4 400 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ISYNA1Q9NPH2 558 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 AKIP1Q9NQ31 210 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 NANSQ9NR45 359 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 OR6C70A6NIJ9 312 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 C12orf71A8MTZ7 269 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 J3QRE1 110 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 GYPBP06028 91 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 SOX6P35712 828 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 EGR4Q05215 589 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 TCEAL6Q6IPX3 200 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 POMZP3Q6PJE2 187 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 SDR9C7Q8NEX9 313 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 TCEAL3Q969E4 200 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 C8orf44Q96CB5 159 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 TBX5Q99593 518 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 CDADC1Q9BWV3 514 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ASPNQ9BXN1 380 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ADAM19Q9H013 955 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A0C4DFX4 3053 aa15.98■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 SP9P0CG40 484 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 PRPS1P60891 318 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 TPBGQ13641 420 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF74Q16587 644 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ARMC4Q5T2S8 1044 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ZFP41Q8N8Y5 198 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF485Q8NCK3 441 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC182A6NF36 153 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 PLD2O14939 933 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 FADS1O60427 444 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 LALBAP00709 142 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 CCL4P13236 92 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF28P17035 718 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 PGCP20142 388 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 CXCR1P25024 350 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 PSPHP78330 225 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 TMED1Q13445 227 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 CBFBQ13951 182 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 INAQ16352 499 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 OR10H4Q8NGA5 316 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 OR5W2Q8NH69 310 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 DUSP19Q8WTR2 217 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 MOGAT1Q96PD6 335 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 JAM3Q9BX67 310 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC26A1Q9H2B4 701 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRTM2O43300 516 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 IGF2P01344 180 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 BMP4P12644 408 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC2A5P22732 501 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 MPLP40238 635 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 BTLAQ7Z6A9 289 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 OR52N1Q8NH53 320 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 NUBPLQ8TB37 319 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-204ENST00000519651 DACH2Q96NX9 599 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms