RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505453.1

PDE4D-212, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5

Gene PDE4D, Length 1,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-212ENST00000505453 C12orf10Q9HB07 376 aa9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-212ENST00000505453 HHATLQ9HCP6 504 aa9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-212ENST00000505453 GALNT9Q9HCQ5 603 aa9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-212ENST00000505453 GPR83Q9NYM4 423 aa9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-212ENST00000505453 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.4□□□□□ -0.9
PDE4D-212ENST00000505453 OSGIN1Q9UJX0 560 aa9.4□□□□□ -0.9
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PDE4D-212ENST00000505453 SURF4O15260 269 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-212ENST00000505453 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
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PDE4D-212ENST00000505453 STSP08842 583 aa9.39□□□□□ -0.91
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PDE4D-212ENST00000505453 SLC15A1P46059 708 aa9.39□□□□□ -0.91
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PDE4D-212ENST00000505453 QPRTQ15274 297 aa9.39□□□□□ -0.91
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PDE4D-212ENST00000505453 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-212ENST00000505453 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
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PDE4D-212ENST00000505453 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-212ENST00000505453 OR2T33Q8NG76 320 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-212ENST00000505453 FANK1Q8TC84 345 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-212ENST00000505453 FAR1Q8WVX9 515 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-212ENST00000505453 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.39□□□□□ -0.91
PDE4D-212ENST00000505453 MYDGFQ969H8 173 aa9.39□□□□□ -0.91
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PDE4D-212ENST00000505453 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.39□□□□□ -0.91
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PDE4D-212ENST00000505453 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.39□□□□□ -0.91
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PDE4D-212ENST00000505453 SYT14P1Q58G82 188 aa9.39□□□□□ -0.91
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PDE4D-212ENST00000505453 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PDE4D-212ENST00000505453 LAMA1P25391 3075 aa9.38□□□□□ -0.91
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PDE4D-212ENST00000505453 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.38□□□□□ -0.91
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