RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 SLC22A25Q6T423 547 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 EXT2Q93063 718 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM186Q96B77 213 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CDK15Q96Q40 435 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SDF2Q99470 211 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM114B3SHH9 223 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 NPIPB7O75200 414 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 STX11O75558 287 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 RP2O75695 350 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 UQCRBP14927 111 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 HPGDP15428 266 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 RNF220Q5VTB9 566 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF75AQ96N20 296 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 C12orf49Q9H741 205 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 EXD2Q9NVH0 621 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 IGF2P01344 180 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MSMBP08118 114 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CD55P08174 381 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 DAOP14920 347 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 PRPS1L1P21108 318 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SLC7A1P30825 629 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TP53BP2Q13625 1128 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 AWAT1Q58HT5 328 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 RAB39BQ96DA2 213 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 DIRC2Q96SL1 478 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CA10Q9NS85 328 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 GPR160Q9UJ42 338 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 POLQO75417 2590 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 G3V2L1 256 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SULT2B1O00204 365 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SYNGR3O43761 229 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 NDUFS7O75251 213 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SDC1P18827 310 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 GLRXP35754 106 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MROH9Q5TGP6 573 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TESCQ96BS2 214 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC58Q96CX6 371 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 PAFAH2Q99487 392 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 VDAC3Q9Y277 283 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CRYAAP02489 173 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CHN1P15882 459 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CRHR1P34998 444 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 PIK3R3Q92569 461 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 NELFAQ9H3P2 528 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 OXSMQ9NWU1 459 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 LIPT2A6NK58 231 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 M0R1B8 84 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 LYZL6O75951 148 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF432O94892 652 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 MFN2O95140 757 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF35P13682 527 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 LIPAP38571 399 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-210ENST00000503258 HTR6P50406 440 aa6.67□□□□□ -1.34
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