RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491487.1

CIZ1-222, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 2

Gene CIZ1, Length 339 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-222	ENST00000491487	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	SULT2B1	O00204	365 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	NPPA	P01160	153 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC7A1	P30825	629 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	NUDT2	P50583	147 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	H3F3A	P84243	136 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	LIPE	Q05469	1076 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	LTB	Q06643	244 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF550	Q7Z398	422 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	MICU2	Q8IYU8	434 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	RNF148	Q8N7C7	305 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	C12orf49	Q9H741	205 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	CHST11	Q9NPF2	352 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CIZ1-222	ENST00000491487	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	LRRN3	E7EW58	273 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	SIAH2	O43255	324 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	CYTIP	O60759	359 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	SYNGR4	O95473	234 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	NCK1	P16333	377 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	FPR1	P21462	350 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	OR2B6	P58173	313 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	PSME3	P61289	254 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	OR1Q1	Q15612	314 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM99	Q8N816	258 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	GID8	Q9NWU2	228 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	PRSS50	Q9UI38	385 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	POLQ	O75417	2590 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487		A0A0B4J2E0	115 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487		A0A1B0GX12	115 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487		A0A1W2PPR1	153 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	LIPT2	A6NK58	231 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF208	O43345	1280 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	AKR7A3	O95154	331 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	PMS2P2	O95744	297 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	FAM107A	O95990	144 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	CRH	P06850	196 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	COX6B1	P14854	86 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	PRDX6	P30041	224 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	KDELR2	P33947	212 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	OR1E2	P47887	323 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	CDH12	P55289	794 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC25A3	Q00325	362 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	CEACAM7	Q14002	265 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	OR2A2	Q6IF42	318 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	KRT73	Q86Y46	540 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	OR2T12	Q8NG77	320 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	TAAR8	Q969N4	342 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC35B4	Q969S0	331 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF607	Q96SK3	696 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	GJE1	A6NN92	205 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CIZ1-222	ENST00000491487	MSTN	O14793	375 aa		13.12	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms