RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 IKBIPQ70UQ0 350 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF611Q8N823 705 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 OR6K3Q8NGY3 331 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 ACMSDQ8TDX5 336 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 IFT81Q8WYA0 676 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 FCRL1Q96LA6 429 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 CCL19Q99731 98 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 KLHDC3Q9BQ90 382 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 TXLNGYQ9BZA5 131 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 UBTD1Q9HAC8 227 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 Q9N2J8 555 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 GLRX2Q9NS18 164 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 EMCNQ9ULC0 261 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 PROCRQ9UNN8 238 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 PRR14LQ5THK1 2151 aa5.66□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A0J9YW62 118 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1W2PRB8 838 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 H3BML4 177 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 H3BQF6 201 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 HS3ST1O14792 307 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 RIPK2O43353 540 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 EFNA2O43921 213 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 PRPS2P11908 318 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 FCGR2AP12318 317 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF17P17021 662 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 GATA3P23771 443 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 NTSP30990 170 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 LCN1P31025 176 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNJ5P48544 419 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJB13P59910 316 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 NAA20P61599 178 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 STX5Q13190 355 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 PDE7AQ13946 482 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC29A2Q14542 456 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 MFSD12Q6NUT3 480 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 EXOC3L1Q86VI1 746 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 CDRT4Q8N9R6 151 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 OR10D3Q8NH80 312 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 POC1BQ8TC44 478 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 PIK3R3Q92569 461 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 OSTF1Q92882 214 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 PERPQ96FX8 193 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 KLHL4Q9C0H6 718 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 C3orf14Q9HBI5 128 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 HHATLQ9HCP6 504 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 MID1IP1Q9NPA3 183 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 MED17Q9NVC6 651 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 RLIMQ9NVW2 624 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 DCDC2Q9UHG0 476 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 COX11Q9Y6N1 276 aa5.65□□□□□ -1.5
PRPF40A-210ENST00000489741 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 PCNX3Q9H6A9 2034 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1W2PPM1 405 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1W2PQD3 144 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 INAFM1C9JVW0 142 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 GOLGA8RI6L899 631 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC16A6O15403 523 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 CXCL13O43927 109 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 CRLF1O75462 422 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNK2O95069 426 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 CHEK2O96017 543 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 OPN1LWP04000 364 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 LINGO3P0C6S8 592 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 DANCRP0C864 163 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 UROSP10746 265 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 ACP2P11117 423 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 PCSK6P29122 969 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 NR1H2P55055 460 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC18A2Q05940 514 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 TNK1Q13470 666 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 SGCBQ16585 318 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 PLPPR5Q32ZL2 321 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 VPS26BQ4G0F5 336 aa5.64□□□□□ -1.51
PRPF40A-210ENST00000489741 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms