RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-208ENST00000489554 PRSS23O95084 383 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 ANGPTL1O95841 491 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 IL18BPO95998 194 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 IFNA14P01570 189 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 MT-ND1P03886 318 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 PEPDP12955 493 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 UQCRBP14927 111 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 IL7RP16871 459 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 HK1P19367 917 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 OPRM1P35372 400 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 OR1E2P47887 323 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 DLX5P56178 289 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 CLDN18P56856 261 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF117Q03924 483 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 SRYQ05066 204 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 CHRNB3Q05901 458 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 MYBPHQ13203 477 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 IFI44LQ53G44 452 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 RAET1LQ5VY80 246 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 CBLN3Q6UW01 205 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 ARSKQ6UWY0 536 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 CMIPQ8IY22 773 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 LILRA2Q8N149 483 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 GATSQ8NAP1 163 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 WNT2BQ93097 391 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 TPD52L3Q96J77 140 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 SEPHS2Q99611 448 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 BDH2Q9BUT1 245 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 C9orf16Q9BUW7 83 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 MAGIXQ9H6Y5 334 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 ADPRHL2Q9NX46 363 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 MED11Q9P086 117 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 BAG5Q9UL15 447 aa9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 APCP25054 2843 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 CLCA1A8K7I4 914 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 AP3D1O14617 1153 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 FFAR1O14842 300 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 HCRTR2O43614 444 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 NDUFB5O43674 189 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 RCBTB2O95199 551 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 LYPD3O95274 346 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 THY1P04216 161 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 GKN3PP0CG01 181 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 RAP2AP10114 183 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 HPGDP15428 266 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 HTR2AP28223 471 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 UQCRC1P31930 480 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 STARP49675 285 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 HOXC5Q00444 222 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 HMBOX1Q6NT76 420 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 POMZP3Q6PJE2 187 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 CARM1Q86X55 608 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 MISPQ8IVT2 679 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 MEIOBQ8N635 442 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF614Q8N883 585 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 C9orf106Q8NAJ2 232 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF527Q8NB42 609 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 RASSF5Q8WWW0 418 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 SLC35B4Q969S0 331 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 PIGQQ9BRB3 760 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 PRR14Q9BWN1 585 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 IL1RAPQ9NPH3 570 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 VNN3Q9NY84 501 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 CLCF1Q9UBD9 225 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 SCOCQ9UIL1 159 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 RIMS3Q9UJD0 308 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 ICAM5Q9UMF0 924 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 AURKCQ9UQB9 309 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.5□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 HCFC1P51610 2035 aa9.49□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 FBN2P35556 2912 aa9.49□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 A0A087WZY1 265 aa9.49□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa9.49□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 J3KTA2 159 aa9.49□□□□□ -0.89
SCAMP4-208ENST00000489554 hCG_2039718K7EN88 272 aa9.49□□□□□ -0.89
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