RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486917.1

PRRT1-208, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, human

TSL 5

Gene PRRT1, Length 620 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRRT1-208	ENST00000486917	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	CLDN24	A6NM45	220 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	SPAG7	O75391	227 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	CSF3	P09919	207 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	MAGEA8	P43361	318 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	EFNA4	P52798	201 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	PHC1	P78364	1004 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	SLC25A3	Q00325	362 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	SMU1	Q2TAY7	513 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	CASP12	Q6UXS9	341 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	PROX1	Q92786	737 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ZIM3	Q96PE6	472 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	BEX2	Q9BXY8	128 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	LY6H	O94772	140 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	BPGM	P07738	259 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	NUDT17	P0C025	328 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	IMPDH2	P12268	514 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	UQCRC2	P22695	453 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	OR2B6	P58173	313 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	KCNJ10	P78508	379 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	SAXO2	Q658L1	398 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ANKRD46	Q86W74	232 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	NEURL3	Q96EH8	262 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	FKRP	Q9H9S5	495 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	VWC2L	B2RUY7	222 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	AP3D1	O14617	1153 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ZNF208	O43345	1280 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	BMP4	P12644	408 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	CCNA2	P20248	432 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	THBS2	P35442	1172 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	HTR3A	P46098	478 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	KHK	P50053	298 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	SLC35A1	P78382	337 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	CHRNB3	Q05901	458 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	SLC17A1	Q14916	467 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	MST1L	Q2TV78	715 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	TESC	Q96BS2	214 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	UPB1	Q9UBR1	384 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	TMEM72	A0PK05	275 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	HMGN4	O00479	90 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	LMX1B	O60663	402 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	C1QC	P02747	245 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	CREB1	P16220	341 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	IGFBP5	P24593	272 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ETV4	P43268	484 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	TGFBR3	Q03167	851 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	CASP8	Q14790	479 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	GPAT3	Q53EU6	434 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PRRT1-208	ENST00000486917	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		12.46	□□□□□ -0.41

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