RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 PRPS1L1P21108 318 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ALDH3A1P30838 453 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 FABP6P51161 128 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC16A1P53985 500 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.25□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 INPP5KQ9BT40 448 aa8.25□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 OR11A1Q9GZK7 315 aa8.25□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 ASB6Q9NWX5 421 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 MKS1Q9NXB0 559 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 METRNQ9UJH8 293 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 MKLN1Q9UL63 735 aa8.25□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 PMS2P2O95744 297 aa8.24□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 G6PDP11413 515 aa8.24□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 CARTPTQ16568 116 aa8.24□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 PGS1Q32NB8 556 aa8.24□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.24□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 EMBQ6PCB8 327 aa8.24□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.24□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.24□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL5BQ96KC2 179 aa8.24□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC35G5Q96KT7 338 aa8.24□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 MUS81Q96NY9 551 aa8.24□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 SLC17A7Q9P2U7 560 aa8.24□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa8.24□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.24□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0A6YYJ9 748 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 CLDN24A6NM45 220 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD28O15084 1053 aa8.23□□□□□ -1.09
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SMARCE1-210ENST00000481231 CLDN8P56748 225 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2B6P58173 313 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 H3F3AP84243 136 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 LGALS3BPQ08380 585 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 FUT5Q11128 374 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 IQCCQ4KMZ1 466 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 GRINAQ7Z429 371 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 HMGN2P46Q86SG4 172 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF563Q8TA94 476 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB8BQ92930 207 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 TUBGCP3Q96CW5 907 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ZG16BQ96DA0 208 aa8.23□□□□□ -1.09
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