RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EHFQ9NZC4 300 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DPM1O60762 260 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARRDC2Q8TBH0 407 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RARRES3Q9UL19 164 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 METTL15A6NJ78 407 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STK17BO94768 372 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FUCA1P04066 466 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC1A3P43003 542 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACY1Q03154 408 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C3orf38Q5JPI3 329 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COX15Q7KZN9 410 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAS1R1Q7RTX1 841 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR13C2Q8NGS9 318 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ST7LQ8TDW4 575 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WASH6PQ9NQA3 447 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNFRSF10AO00220 468 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APEX1P27695 318 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10K1Q8NGX5 313 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR6F1Q8NGZ6 308 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF480Q8WV37 535 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MIB2Q96AX9 1013 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNX18Q96RF0 628 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC19A3Q9BZV2 496 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC22A23A1A5C7 686 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC43A1O75387 559 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NTSR1P30989 418 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLDN12P56749 244 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FCN2Q15485 313 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM122CQ6P4D5 195 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDUFAF7Q7L592 441 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLHDC9Q8NEP7 349 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HCAR1Q9BXC0 346 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 I3L1I5 382 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EDIL3O43854 480 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCGB2A1O75556 95 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLDN22Q8N7P3 220 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF454Q8N9F8 522 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR5M11Q96RB7 305 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LPAR4Q99677 370 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSD2Q9BQI7 771 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10A5Q9H207 317 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10A2Q9H208 303 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINC00597Q9H2U6 94 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HCSTQ9UBK5 93 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RFXAPO00287 272 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPP30P78346 268 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXK1P85037 733 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBPL2Q6SJ96 375 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBXN10Q96LJ8 280 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NTN4Q9HB63 628 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPNE7Q9UBL6 633 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EFCAB7A8K855 629 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSMB5P28074 263 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EMP2P54851 167 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC14A2Q15849 920 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VASNQ6EMK4 673 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCEAL8Q8IYN2 117 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LGALS14Q8TCE9 139 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HRASLS5Q96KN8 279 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARPC5LQ9BPX5 153 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SAMD10Q9BYL1 202 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARGFXA6NJG6 315 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACOD1A6NK06 481 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GABARAPO95166 117 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SHC1P29353 583 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR7E24Q6IFN5 339 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SFXN4Q6P4A7 337 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BTBD2Q9BX70 525 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GFOD1Q9NXC2 390 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLHL42Q9P2K6 505 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FTSJ1Q9UET6 329 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0J9YY10 115 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2T1O43869 369 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RABIFP47224 123 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RGRP47804 291 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IDO2Q6ZQW0 420 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAMK2DQ13557 499 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LIX1LQ8IVB5 337 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIDE1A8MVS5 230 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms