RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478365.1

DDX39B-218, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-218ENST00000478365 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 LILRA2Q8N149 483 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 CLEC4FQ8N1N0 589 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 ANKFN1Q8N957 763 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 OR52P1PQ8NH57 321 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 OR10D3Q8NH80 312 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 FBXO27Q8NI29 283 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 SLC38A5Q8WUX1 472 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 SMPDL3BQ92485 455 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 C14orf79Q96F83 325 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 TMEM19Q96HH6 336 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 RNF122Q9H9V4 155 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 KLHL28Q9NXS3 571 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 A0A1W2PNV4 684 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 CDHR4A6H8M9 788 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 B4DXG7 233 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF208O43345 1280 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 GMFGO60234 142 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 SNX3O60493 162 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 PRKAR1BP31321 381 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 SLC1A3P43003 542 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 CPA2P48052 419 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 CASP9P55211 416 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 CLDN20P56880 219 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 RAC3P60763 192 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 CDK6Q00534 326 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 TFF3Q07654 80 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 MERTKQ12866 999 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 PON3Q15166 354 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 GTDC1Q4AE62 458 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 CEP78Q5JTW2 689 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 FAM209AQ5JX71 171 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 SSX8Q7RTT4 187 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 GGNQ86UU5 652 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 STK32CQ86UX6 486 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 HIPK4Q8NE63 616 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 OR8J3Q8NGG0 315 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 FAM222BQ8WU58 562 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 STMN2Q93045 179 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 DDIT4LQ96D03 193 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 ADGRG7Q96K78 797 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 CEP19Q96LK0 163 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 PALMDQ9NP74 551 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 JKAMPQ9P055 326 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 EMC3Q9P0I2 261 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 EDARQ9UNE0 448 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 MPDZO75970 2070 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 NKX2-6A6NCS4 301 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 C17orf51A8MQB3 221 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 TNFSF11O14788 317 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 PGM3O95394 542 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-218ENST00000478365 IFNA14P01570 189 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms