RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 RASD2Q96D21 266 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SGTBQ96EQ0 304 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 NMNAT3Q96T66 252 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 BLACEA4D250 179 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 FABP12A6NFH5 140 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 UTS2O95399 124 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PTTG1O95997 202 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TFP02787 698 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 HLA-DPB1P04440 258 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 HPGDP15428 266 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 MST1P26927 711 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 COPZ1P61923 177 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ERVK-25P63136 954 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ACSM1Q08AH1 577 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SERTAD2Q14140 314 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 KCNJ8Q15842 424 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 DTX3Q8N9I9 347 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 OR13C5Q8NGS8 318 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 OR5J2Q8NH18 312 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF721Q8TF20 911 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 WDFY2Q96P53 400 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ATF6BQ99941 703 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 MED18Q9BUE0 208 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 NUDT9Q9BW91 350 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 JAM3Q9BX67 310 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 RNF32Q9H0A6 362 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PRODH2Q9UF12 536 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 EPHA6Q9UF33 1036 aa8.13□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1W2PQ09 198 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 EFCAB7A8K855 629 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SOX30O94993 753 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 NDUFB2O95178 105 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 DDAH2O95865 285 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 IL7P13232 177 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SHC1P29353 583 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 DAB2P98082 770 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 NSDHLQ15738 373 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TP53I3Q53FA7 332 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 Q7L0L9 218 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 C10orf53Q8N6V4 93 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 CCDC32Q9BV29 185 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 CHRDQ9H2X0 955 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ASB6Q9NWX5 421 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1W2PPK0 400 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 OR6C68A6NDL8 312 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PSMD9O00233 223 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SNPHO15079 494 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 TMCC2O75069 709 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ICOSLGO75144 302 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 GUSBP08236 651 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PYCR1P32322 319 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 AQP2P41181 271 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 RFX2P48378 723 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 GPR143P51810 404 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 P2RY14Q15391 338 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 DDI2Q5TDH0 399 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 LANCL3Q6ZV70 420 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ADIPOR1Q96A54 375 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 RAB33BQ9H082 229 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 WNT16Q9UBV4 365 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.12□□□□□ -1.11
CDHR3-211ENST00000478080 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms