RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 NPIPB7O75200 414 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 C8BP07358 591 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 EPXP11678 715 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 IMPDH2P12268 514 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 DMTNQ08495 405 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 VMACQ2NL98 169 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 RABL3Q5HYI8 236 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 COMTD1Q86VU5 262 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TUSC5Q8IXB3 177 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 C3orf49Q96BT1 292 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF583Q96ND8 569 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 DACH2Q96NX9 599 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 C12orf10Q9HB07 376 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 GID8Q9NWU2 228 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF724A8MTY0 619 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CTAG2O75638 210 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TFPIP10646 304 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 KLK2P20151 261 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CXCR1P25024 350 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 PCGF2P35227 344 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CPA2P48052 419 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 GYS2P54840 703 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 VEZF1Q14119 521 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 DUSP7Q16829 419 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CYP51A1Q16850 503 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 POLQO75417 2590 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 A8MVM7 634 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 FRS3O43559 492 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TPST2O60704 377 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 GOSR1O95249 250 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 LGI1O95970 557 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 FESP07332 822 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 COX4I1P13073 169 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CCNA2P20248 432 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 AQP1P29972 269 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 UGT2B10P36537 528 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 KCNJ5P48544 419 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 SLC16A1P53985 500 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP10-9P60411 292 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 HOXC5Q00444 222 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 BEND4Q6ZU67 534 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TREML1Q86YW5 311 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 CADM2Q8N3J6 435 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 LINC01560Q8TB33 94 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 STK35Q8TDR2 534 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 LURAP1Q96LR2 239 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 ECSITQ9BQ95 431 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 TRIM2Q9C040 744 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-216ENST00000475195 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF716A6NP11 495 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 C16orf97H3BN30 126 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 POU2F1P14859 743 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 CRYBA2P53672 197 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 SLC35A1P78382 337 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 RCN3Q96D15 328 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 KLHL28Q9NXS3 571 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 SH3D21A4FU49 640 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 LIPT2A6NK58 231 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 A6NNC1 897 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 FMO6PO60774 539 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 FZD7O75084 574 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 CD247P20963 164 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 FPR1P21462 350 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-216ENST00000475195 HTR2AP28223 471 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms