RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473542.1

BBX-223, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 3

Gene BBX, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-223	ENST00000473542	CDH4	P55283	916 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	TRIM69	Q86WT6	500 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MTMR9	Q96QG7	549 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SLITRK2	Q9H156	845 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	YY1AP1	Q9H869	796 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MARCH5	Q9NX47	278 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	HYPK	Q9NX55	129 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542		A0A1B0GUS0	222 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	HELT	A6NFD8	242 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ZFP92	A6NM28	416 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542		K7N7A8	449 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SNAPIN	O95295	136 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	AQP1	P29972	269 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	GNA11	P29992	359 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CCR1	P32246	355 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	VGLL4	Q14135	290 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	KYAT1	Q16773	422 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ST8SIA1	Q92185	356 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	C10orf35	Q96D05	121 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CLCC1	Q96S66	551 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	TBX15	Q96SF7	602 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	GAL3ST1	Q99999	423 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	NICN1	Q9BSH3	213 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	REEP4	Q9H6H4	257 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	NIPAL2	Q9H841	368 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	DCTN6	O00399	190 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ZNF264	O43296	627 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MED7	O43513	233 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	DIRAS1	O95057	198 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SNX4	O95219	450 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	LY6G6D	O95868	133 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MX1	P20591	662 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	IL12A	P29459	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	DDOST	P39656	456 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	OPRD1	P41143	372 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	KIR2DS4	P43632	304 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	PKNOX1	P55347	436 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	RIPK4	P57078	832 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	OGDH	Q02218	1023 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	GRB7	Q14451	532 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	UTS2B	Q765I0	119 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	VRK2	Q86Y07	508 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	CNPY4	Q8N129	248 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	RAPGEF5	Q92565	580 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	TPD52L3	Q96J77	140 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	MAGEB18	Q96M61	343 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	ZNF639	Q9UID6	485 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	IFT52	Q9Y366	437 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	NPTN	Q9Y639	398 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-223	ENST00000473542	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-223	ENST00000473542	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-223	ENST00000473542	UGT1A9	O60656	530 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-223	ENST00000473542	BBOX1	O75936	387 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-223	ENST00000473542	ATP5L	O75964	103 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-223	ENST00000473542	OR3A4P	P47883	348 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-223	ENST00000473542	SEC61G	P60059	68 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-223	ENST00000473542	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-223	ENST00000473542	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-223	ENST00000473542	PARP15	Q460N3	678 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-223	ENST00000473542	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-223	ENST00000473542	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-223	ENST00000473542	FHL5	Q5TD97	284 aa		3.33	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms