RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 SCN2AQ99250 2005 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 HOXA2O43364 376 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 EMC8O43402 210 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 FKTNO75072 461 aa12.49□□□□□ -0.41
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SH3BP1-206ENST00000469947 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 LRIG1Q96JA1 1093 aa12.49□□□□□ -0.41
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SH3BP1-206ENST00000469947 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP12.48□□□□□ -0.41
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SH3BP1-206ENST00000469947 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 NAP1L6A6NFF2 107 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 HMSDA8MTL9 139 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PEX12O00623 359 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 GNB5O14775 395 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF749O43361 778 aa12.47□□□□□ -0.41
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