RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	UGT2B17	O75795	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	HCK	P08631	526 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ALPI	P09923	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CALM1	P0DP23	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CALM2	P0DP24	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CALM3	P0DP25	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	IGFBP5	P24593	272 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ACVR1B	P36896	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PEX19	P40855	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PRRX1	P54821	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	GBE1	Q04446	702 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	KLRC3	Q07444	240 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PUDP	Q08623	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	BST1	Q10588	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	IL18R1	Q13478	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ALX1	Q15699	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PCK2	Q16822	640 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	NTNG2	Q96CW9	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF597	Q96LX8	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SENP1	Q9P0U3	644 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBBP4-208	ENST00000463378	SLIT3	O75094	1523 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A075B6Q4	140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	NBR2	O15453	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	GYPC	P04921	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	SERPINB2	P05120	415 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	CYP2B6	P20813	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	GAL	P22466	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	MMP11	P24347	488 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	PRMT2	P55345	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	CCL14	Q16627	93 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	MICA	Q29983	383 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	BAD	Q92934	168 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	NANS	Q9NR45	359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM94	Q12767	1356 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1B0GUA9	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRTM2	O43300	516 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	CLDN9	O95484	217 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	NCK1	P16333	377 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	SERPINA2	P20848	420 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	CRMP1	Q14194	572 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	LAGE3	Q14657	143 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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