RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PRSS50Q9UI38 385 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 IFT52Q9Y366 437 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 HIVEP2P31629 2446 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CDHR4A6H8M9 788 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF716A6NP11 495 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CLIC1O00299 241 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ADAM11O75078 769 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 THBS1P07996 1170 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ETFAP13804 333 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 GGT1P19440 569 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CCNA2P20248 432 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 COX5AP20674 150 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 IGHV1-2P23083 117 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CXCR1P25024 350 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TACR3P29371 465 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PTH2RP49190 550 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MVDP53602 400 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CRISP3P54108 245 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 DSTNP60981 165 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 COPZ1P61923 177 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PLAURQ03405 335 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TSC22D1Q15714 1073 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MAPK11Q15759 364 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 LIN52Q52LA3 116 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 Q5PR19 223 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MAVSQ7Z434 540 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC103Q8IW40 242 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 GTF2H4Q92759 462 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 APH1AQ96BI3 265 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PERPQ96FX8 193 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 RADILQ96JH8 1075 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 C7orf26Q96N11 449 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 MUS81Q96NY9 551 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PIF1Q9H611 641 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ASB6Q9NWX5 421 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 JMJD1CQ15652 2540 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 A0A096LPI6 279 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CIB4A0PJX0 185 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM72A0PK05 275 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 DPRXA6NFQ7 191 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OR5H1A6NKK0 313 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OVOL3O00110 214 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 AP3D1O14617 1153 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 LYZL6O75951 148 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 GPIP06744 558 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 IMPDH2P12268 514 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 BMP2P12643 396 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 NTF4P34130 210 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 IDH3AP50213 366 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 STX1BP61266 288 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 TGFBR3Q03167 851 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 FADDQ13158 208 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 SLC17A1Q14916 467 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PPA1Q15181 289 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 RGNQ15493 299 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 RNF220Q5VTB9 566 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRF-210ENST00000463041 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.43□□□□□ -1.38
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