RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 UBL4AP11441 157 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CD53P19397 219 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CD40LGP29965 261 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SLC6A6P31641 620 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 GABRA5P31644 462 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINB10P48595 397 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PPP5CP53041 499 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PNLIPRP2P54317 469 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FOXL2P58012 376 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ACY1Q03154 408 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF85Q03923 595 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF117Q03924 483 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 CRMP1Q14194 572 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF846Q147U1 533 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OXA1LQ15070 435 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF74Q16587 644 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF684Q5T5D7 378 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LCE1DQ5T752 114 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf189Q5VU69 101 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LCN10Q6JVE6 187 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SLC23A3Q6PIS1 610 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM91Q6ZNR0 172 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 RTL4Q6ZR62 310 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 SHFQ7M4L6 423 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 GPR135Q8IZ08 494 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC17Q8N6Y2 441 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF511Q8NB15 262 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB44Q8NCP5 570 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NPEPL1Q8NDH3 523 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PSD4Q8NDX1 1056 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR8K3Q8NH51 312 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MCFD2Q8NI22 146 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 STT3BQ8TCJ2 826 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZNRF4Q8WWF5 429 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 EDAQ92838 391 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 HGDQ93099 445 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TP53INP1Q96A56 240 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SGTBQ96EQ0 304 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ART5Q96L15 291 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 WDFY2Q96P53 400 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TEAD3Q99594 435 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MROQ9BYG7 248 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR8D2Q9GZM6 311 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 LRRN3Q9H3W5 708 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MED20Q9H944 212 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HMG20AQ9NP66 347 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MMP25Q9NPA2 562 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
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PTPRC-210ENST00000462363 ASB6Q9NWX5 421 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO4Q9UKT5 387 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 CACNA1HO95180 2353 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SPEGQ15772 3267 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 OR6C70A6NIJ9 312 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A31A6NKX4 558 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 A8MU76 341 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 A8MUA0 341 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 PATE3B3GLJ2 98 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 IDSB3KWA1 339 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRC-210ENST00000462363 D6RAR5 112 aa5.14□□□□□ -1.59
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