RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 UFM1P61960 85 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SPOCK1Q08629 439 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 STX3Q13277 289 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SYPL1Q16563 259 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 DPY19L1Q2PZI1 675 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 AGAP6Q5VW22 663 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR93Q6P2C0 686 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SSX8Q7RTT4 187 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 MREGQ8N565 214 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PIGXQ8TBF5 258 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ASB6Q9NWX5 421 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM181Q9P2C4 612 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 POU2F3Q9UKI9 436 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TMED7Q9Y3B3 224 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM72A0PK05 275 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 AGAP5A6NIR3 686 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 M0R1B8 84 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TM9SF1O15321 606 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 DNPH1O43598 174 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SSX4O60224 188 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 IMPDH2P12268 514 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PTAFRP25105 342 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CD40P25942 277 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TACR3P29371 465 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 IL12AP29459 219 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CDKN2CP42773 168 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC16A1P53985 500 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC35A1P78382 337 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 BST1Q10588 318 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 COX20Q5RI15 118 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 C9orf135Q5VTT2 229 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM108Q6UXF1 575 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CASP12Q6UXS9 341 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF621Q6ZSS3 439 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 RADILQ96JH8 1075 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 OR52E6Q96RD3 313 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PANX1Q96RD7 426 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 DHRS9Q9BPW9 319 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 AIG1Q9NVV5 245 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TAS2R16Q9NYV7 291 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 MALT1Q9UDY8 824 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 HAO1Q9UJM8 370 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 OSGIN1Q9UJX0 560 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAPPC4Q9Y296 219 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CFAP73A6NFT4 308 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SDHDO14521 159 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PGRP06401 933 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ITGA5P08648 1049 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 NR2F1P10589 423 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 IL7RP16871 459 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TTKP33981 857 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC1A3P43003 542 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 MAGEA8P43361 318 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 H3F3AP84243 136 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 GNA13Q14344 377 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 GABRA6Q16445 453 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 NRF1Q16656 503 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 HHATQ5VTY9 493 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 OGFOD2Q6N063 350 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CMIPQ8IY22 773 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC34Q8IZ02 419 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms