RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 FCRL4Q96PJ5 515 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ATG10Q9H0Y0 220 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGMQ9H3S5 423 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PPE3 182 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 C5orf58C9J3I9 102 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 F5H5P2 479 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ETHE1O95571 254 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 BCHEP06276 602 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ARAFP10398 606 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 BDKRB2P30411 391 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DLX5P56178 289 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GMFBP60983 142 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB103AP81534 67 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 EFNB1P98172 346 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK5Q00535 292 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CACNG1Q06432 222 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC3A1Q07837 685 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PGAP1Q75T13 922 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4K5Q8NGD3 323 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 STK35Q8TDR2 534 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ECHDC3Q96DC8 303 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF558Q96NG5 402 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PDFQ9HBH1 243 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R5Q9NYW4 299 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR89AB7ZAQ6 455 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 INSIG1O15503 277 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A12O75746 678 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR89BP0CG08 455 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 UBBP0CG47 229 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SHC2P98077 582 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 MC1RQ01726 317 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF212Q495C1 297 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FUT10Q6P4F1 479 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TMPRSS11BQ86T26 416 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TPRA1Q86W33 373 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP52Q8N1V2 620 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52I2Q8NH67 350 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ING5Q8WYH8 240 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PLD4Q96BZ4 506 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAM2Q99965 735 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 GULP1Q9UBP9 304 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 KLK11Q9UBX7 282 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.77□□□□□ -1.16
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GTQ1 180 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6C76A6NM76 312 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf74A8MZ97 194 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T1O43869 369 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PTHLHP12272 177 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ATF1P18846 271 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 AOAHP28039 575 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 AHRP35869 848 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 ART1P52961 327 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 IRF8Q02556 426 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 FZD5Q13467 585 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 BEX5Q5H9J7 111 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-203ENST00000439720 SSX9Q7RTT3 188 aa7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms