RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 TCN2P20062 427 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 PTNP21246 168 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 CXCR1P25024 350 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 SLC6A6P31641 620 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 HTR3AP46098 478 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 P2RX1P51575 399 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 NUDT6P53370 316 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 CLDN6P56747 220 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 FBXW4P57775 412 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 ST3GAL4Q11206 333 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 RAB39AQ14964 217 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 PGGHGQ32M88 737 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 KLHL22Q53GT1 634 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 HES3Q5TGS1 186 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 STPG1Q5TH74 334 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 OPN5Q6U736 354 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 CBLN3Q6UW01 205 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 RTL4Q6ZR62 310 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 GLRX5Q86SX6 157 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 SGCDQ92629 289 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 HGDQ93099 445 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 RFKQ969G6 155 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 MUL1Q969V5 352 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 NACC2Q96BF6 587 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 ARSGQ96EG1 525 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 CRELD1Q96HD1 420 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 LRR1Q96L50 414 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 IFT27Q9BW83 186 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 GPR87Q9BY21 358 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 OR52D1Q9H346 318 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 UBQLN3Q9H347 655 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 AMBNQ9NP70 447 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 GPR83Q9NYM4 423 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 MYOTQ9UBF9 498 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 TCFL5Q9UL49 500 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PQ72 361 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 C21orf140B9A014 251 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 SOCS6O14544 535 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 SURF4O15260 269 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 PRODHO43272 600 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 PRKYO43930 277 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 PTP4A3O75365 173 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A12O75746 678 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 OR2J2O76002 312 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 SEC14L2O76054 403 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 TNFSF15O95150 251 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 NDUFB2O95178 105 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 CH25HO95992 272 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 IFNGP01579 166 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 HIST1H2ABP04908 130 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 HK1P19367 917 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 FUT1P19526 365 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 PCMT1P22061 227 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 PSMB9P28065 219 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 TACR3P29371 465 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC8-211ENST00000415409 OTX2P32243 289 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms