RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 OR8G3PP0DMU2 310 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 BLOC1S1P78537 153 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TDGQ13569 410 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 GNMTQ14749 295 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC190Q86UF4 302 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 RASGRP3Q8IV61 690 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC43A2Q8N370 569 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ARL14Q8N4G2 192 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFAND1Q8TCF1 268 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM43Q9BTV4 400 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 GLTPQ9NZD2 209 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ABI3Q9P2A4 366 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 URB1O60287 2271 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 LRIT2A6NDA9 550 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 MEIS3P1A6NDR6 274 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TRABD2BA6NFA1 517 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 A6NIZ1 184 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 H0YGG7 62 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PVRP15151 417 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 AQP2P41181 271 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 RAP1BP61224 184 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 RAP1AP62834 184 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR50Q13585 617 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TPBGQ13641 420 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PRSS36Q5K4E3 855 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM244Q5VVB8 128 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 NKAIN4Q8IVV8 208 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 MMP21Q8N119 569 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC2A12Q8TD20 617 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 CSF3RQ99062 836 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 INIPQ9NRY2 104 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 EMC3Q9P0I2 261 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1B0GWA3 101 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 BCL6P41182 706 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 GALK2Q01415 458 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR18Q14330 331 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB30Q15771 203 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 METRNLQ641Q3 311 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PMM1Q92871 262 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 UBQLN4Q9NRR5 601 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 M0R082 166 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 P2RX6O15547 441 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 HSPA12AO43301 675 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 RAD51DO75771 328 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PDGFAP04085 211 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP1B1P05026 303 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 CXADRP78310 365 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR176Q14439 515 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF750Q32MQ0 723 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 MFSD4AQ8N468 514 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 NAXEQ8NCW5 288 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM185AQ8NFB2 350 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 MED30Q96HR3 178 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ALG12Q9BV10 488 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 HDAC8Q9BY41 377 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SRRQ9GZT4 340 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBP1Q9H171 429 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SIRT5Q9NXA8 310 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 MOKQ9UQ07 419 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 FOCADQ5VW36 1801 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SMLR1H3BR10 107 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF84P51523 738 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 RACK1P63244 317 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZMYND11Q15326 602 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 C1orf189Q5VU69 101 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TIGD3Q6B0B8 471 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR155Q7Z3F1 870 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 CAMKMTQ7Z624 323 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 BCL2L10Q9HD36 194 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 DUX1O43812 170 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 IRS1P35568 1242 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 CLDN12P56749 244 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 Q499Y3 187 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 C1orf94Q6P1W5 598 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 OR5L2Q8NGL0 311 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB8AQ96BR9 441 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 OR14A2Q96R54 314 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 CDC6Q99741 560 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 PRSS16Q9NQE7 514 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 STARD5Q9NSY2 213 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 HIF3AQ9Y2N7 669 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDSP2-201ENST00000398073 TMPRSS11DO60235 418 aa15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms