RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ZFP3Q96NJ6 502 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 OR5B2Q96R09 309 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TM9SF2Q99805 663 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PSD2Q9BQI7 771 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 BCO1Q9HAY6 547 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 HHATLQ9HCP6 504 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CHST11Q9NPF2 352 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 GALNT8Q9NY28 637 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM181Q9P2C4 612 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ABCD2Q9UBJ2 740 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CHRNA9Q9UGM1 479 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ADAM21Q9UKJ8 722 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ROS1P08922 2347 aa3.09□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SPG11Q96JI7 2443 aa3.09□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 NOTCH2Q04721 2471 aa3.09□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 POLQO75417 2590 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 RTTNQ86VV8 2226 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 A0A087WUJ7 227 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 A0A0B4J2E0 115 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 A0A1B0GX12 115 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ELOVL7A1L3X0 281 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PRORSD1PA6NEY8 169 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 LIPT2A6NK58 231 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 A8MVM7 634 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 LRRN3E7EW58 273 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SULT2B1O00204 365 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 DVL2O14641 736 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MSTNO14793 375 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SERPINB7O75635 380 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PRSS23O95084 383 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 AKR7A3O95154 331 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SYNGR4O95473 234 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PMS2P2O95744 297 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 FAM107AO95990 144 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 BGLAPP02818 100 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CRHP06850 196 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 THBDP07204 575 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 C8BP07358 591 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 TFPIP10646 304 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 COX6B1P14854 86 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 NCK1P16333 377 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 FPR1P21462 350 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CBLP22681 906 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ME2P23368 584 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PRDX6P30041 224 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 UQCRC1P31930 480 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 KDELR2P33947 212 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CPOXP36551 454 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 HTR3AP46098 478 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 OR1E2P47887 323 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 NUDT2P50583 147 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SLC7A2P52569 658 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CDH12P55289 794 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 OR2B6P58173 313 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PSME3P61289 254 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SLC25A3Q00325 362 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 LIPEQ05469 1076 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CEACAM7Q14002 265 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 VEZF1Q14119 521 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 GNA13Q14344 377 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 KRT72Q14CN4 511 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MAPRE2Q15555 327 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 OR7A5Q15622 319 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 TSC22D1Q15714 1073 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ZSWIM7Q19AV6 140 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 MMEL1Q495T6 779 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 IQCCQ4KMZ1 466 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 CYBRD1Q53TN4 286 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 C1orf140Q5VVS0 124 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ANKRD34AQ69YU3 496 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 OR2A2Q6IF42 318 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 PPP4R4Q6NUP7 873 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 TFAP2EQ6VUC0 442 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD17-201ENST00000390930 LINC00114Q6XXX2 140 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms