RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 FUZQ9BT04 418 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 ASF1BQ9NVP2 202 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 RHCGQ9UBD6 479 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 OSGIN1Q9UJX0 560 aa26.72■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 IGHG3P01860 377 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 THY1P04216 161 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 HTR3AP46098 478 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 DHRSXQ8N5I4 330 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 OR10G2Q8NGC3 310 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 SLC41A3Q96GZ6 507 aa26.71■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 EXO5Q9H790 373 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 TMCC3Q9ULS5 477 aa26.71■■□□□ 1.87
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF407Q9C0G0 2248 aa26.71■■□□□ 1.87
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ECHS1-201ENST00000368547 SNAP29O95721 258 aa26.7■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 LAPTM4AQ15012 233 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 TRILQ7L0X0 811 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 GDF7Q7Z4P5 450 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 NEIL3Q8TAT5 605 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 SELENONQ9NZV5 590 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 SLC7A7Q9UM01 511 aa26.7■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 MED12Q93074 2177 aa26.7■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 EFNA2O43921 213 aa26.69■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 IL11P20809 199 aa26.69■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 CAPGP40121 348 aa26.69■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 DCST1Q5T197 706 aa26.69■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRG3Q86Y34 549 aa26.69■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 ATG16L2Q8NAA4 619 aa26.69■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 KIF17Q9P2E2 1029 aa26.69■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF337Q9Y3M9 751 aa26.69■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa26.68■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 ST3GAL3Q11203 375 aa26.68■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC38A4Q969I6 547 aa26.68■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 GPR137Q96N19 417 aa26.68■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 CXCR1P25024 350 aa26.68■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa26.67■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 HSF1Q00613 529 aa26.67■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 TRAM2Q15035 370 aa26.67■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 ELOA3BQ3SY89 546 aa26.67■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 FGD3Q5JSP0 725 aa26.67■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 ELOA3Q8NG57 546 aa26.67■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 SLC7A13Q8TCU3 470 aa26.67■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 FEVQ99581 238 aa26.67■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 TOR3AQ9H497 397 aa26.67■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM185BQ9H7F4 350 aa26.67■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 C12orf10Q9HB07 376 aa26.67■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 CHRNA9Q9UGM1 479 aa26.67■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 PEPDP12955 493 aa26.66■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 TDGF1P3P51864 188 aa26.66■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 TTC23Q5W5X9 447 aa26.66■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa26.66■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 SERINC1Q9NRX5 453 aa26.66■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 KRT84Q9NSB2 600 aa26.66■■□□□ 1.86
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ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GVC2 190 aa26.65■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 SH3PXD2BA1X283 911 aa26.65■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 LINC01387J3KSC0 135 aa26.65■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 BMP7P18075 431 aa26.65■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 CBLP22681 906 aa26.65■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 STARP49675 285 aa26.65■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 SELENBP1Q13228 472 aa26.65■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 KRTCAP3Q53RY4 240 aa26.65■■□□□ 1.86
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD34AQ69YU3 496 aa26.65■■□□□ 1.86
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