RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 FAM81AQ8TBF8 368 aa16.09■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 TEX47Q8TBZ9 253 aa16.09■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 C5orf34Q96MH7 638 aa16.09■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 MOGAT1Q96PD6 335 aa16.09■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 PITX2Q99697 317 aa16.09■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 FAM173AQ9BQD7 235 aa16.09■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 HHATLQ9HCP6 504 aa16.09■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 RAXQ9Y2V3 346 aa16.09■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 SPTBN4Q9H254 2564 aa16.09■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 H3BML4 177 aa16.08■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 OR7A10O76100 309 aa16.08■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 SP1P08047 785 aa16.08■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 IL5RAQ01344 420 aa16.08■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 RAET1LQ5VY80 246 aa16.08■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 UBE2FQ969M7 185 aa16.08■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 TAAR8Q969N4 342 aa16.08■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 MRGPRX4Q96LA9 322 aa16.08■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 SAMD8Q96LT4 415 aa16.08■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 SLC19A3Q9BZV2 496 aa16.08■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 CHRNA9Q9UGM1 479 aa16.08■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 CDH10Q9Y6N8 788 aa16.08■□□□□ 0.17
LTV1-201ENST00000367576 PIEZO1Q92508 2521 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 ZAR1LA6NP61 321 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 RRP8O43159 456 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 EFNA2O43921 213 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 NME2P1O60361 137 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 CBR3O75828 277 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 TFPIP10646 304 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 NME2P22392 152 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 GDF1P27539 372 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 GGT2P36268 569 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 TLE3Q04726 772 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 KEAP1Q14145 624 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 GINS1Q14691 196 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 SLC25A53Q5H9E4 307 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 SLC25A25Q6KCM7 469 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 OAFQ86UD1 273 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 SLC25A36Q96CQ1 311 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 HRASLS5Q96KN8 279 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 OR52D1Q9H346 318 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 ZFP64Q9NPA5 681 aa16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 FAM166BA8MTA8 275 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 A8MVM7 634 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 E9PQ18 207 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 CD46P15529 392 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 MEOX1P50221 254 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 MLLT10P55197 1068 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 FXYD6P3P58550 94 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 LTBQ06643 244 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 FOXO1Q12778 655 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 ZNF74Q16587 644 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 C1orf140Q5VVS0 124 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 HAS2Q92819 552 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 ZBTB8AQ96BR9 441 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 RNF32Q9H0A6 362 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 ENKD1Q9H0I2 346 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 RASSF1Q9NS23 344 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 DKK4Q9UBT3 224 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 SIGLEC7Q9Y286 467 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 A0A087WZY1 265 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 TRAPPC6AO75865 159 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 CEACAM4O75871 244 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 AHSA1O95433 338 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 ELK4P28324 431 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 CD97P48960 835 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 PLGLB1Q02325 96 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 ZNF766Q5HY98 468 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 UGT2A3Q6UWM9 527 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 THSD4Q6ZMP0 1018 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 THAP5Q7Z6K1 395 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 IGFN1Q86VF2 1251 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 OR14L1PQ8NHC6 308 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 CNIH3Q8TBE1 160 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 ARL5BQ96KC2 179 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 APOL4Q9BPW4 351 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 PTDSS2Q9BVG9 487 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 MCCC2Q9HCC0 563 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 CEP295Q9C0D2 2601 aa16.06■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 ZIC3O60481 467 aa16.05■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 HCN1O60741 890 aa16.05■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.169e-6■■■■□ 21.6
LTV1-201ENST00000367576 BGLAPP02818 100 aa16.05■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 SHC1P29353 583 aa16.05■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 SFTPDP35247 375 aa16.05■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 TNFSF10P50591 281 aa16.05■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 DLX5P56178 289 aa16.05■□□□□ 0.16
LTV1-201ENST00000367576 MYBPC1Q00872 1141 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms