RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 FNDC9Q8TBE3 224 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 WFDC5Q8TCV5 224 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 GABRPO00591 440 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 CTDSP2O14595 271 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 ATP1B3P54709 279 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 PFN3P60673 137 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-16P61578 105 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 RELAQ04206 551 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 SPOCK1Q08629 439 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 STK11Q15831 433 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 SLC48A1Q6P1K1 146 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 ADIPOR2Q86V24 386 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 DCUN1D4Q92564 292 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 EDAQ92838 391 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 SLC41A2Q96JW4 573 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 DBHP09172 617 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 OR2T7P0C7T2 308 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 GABRA5P31644 462 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 S100A12P80511 92 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 MZT1Q08AG7 82 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM31Q5JXX7 168 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 ELP2Q6IA86 826 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 STEAP2Q8NFT2 490 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 OR2T27Q8NH04 317 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP19Q8WTR2 217 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM38AQ9H6F2 299 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 CDHR4A6H8M9 788 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 TAPBPO15533 448 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 HCRTR1O43613 425 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN15O95858 294 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 NR4A2P43354 598 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 RAB31Q13636 194 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 CHTF18Q8WVB6 975 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 VN1R3Q9BXE9 311 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 H3BNC9 293 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 ACOT8O14734 319 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 SLC1A3P43003 542 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 MUL1Q969V5 352 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 SLC46A1Q96NT5 459 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA6CQ9H3T2 930 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 PRELID1Q9Y255 219 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 BRWD1Q9NSI6 2320 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 SIGLEC6O43699 453 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 CX3CR1P49238 355 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R19P59542 299 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 NOXA1Q86UR1 476 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 OR6F1Q8NGZ6 308 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 A4GALTQ9NPC4 353 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 MMACHCQ9Y4U1 282 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 KLK4Q9Y5K2 254 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 PKLRP30613 574 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 IL13RA1P78552 427 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 DCDP81605 110 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 PELI3Q8N2H9 469 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 B4DXG7 233 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 IGHEP01854 428 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 CTHP32929 405 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 EFNA3P52797 238 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 SPCS2Q15005 226 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 LTB4RQ15722 352 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 RNF128Q8TEB7 428 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 ALG12Q9BV10 488 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 ULBP3Q9BZM4 244 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 P2RY12Q9H244 342 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHA3Q9HB20 300 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 ASIC5Q9NY37 505 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 RGPD5Q99666 1765 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 PLSCR5A0PG75 271 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 MEIOCA2RUB1 952 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 OR8G3PP0DMU2 310 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 MANEAQ5SRI9 462 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 ZIC5Q96T25 663 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 SULT4A1Q9BR01 284 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 MYO7AQ13402 2215 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 TLCD2A6NGC4 264 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 P2RX6O15547 441 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 CTNSO60931 367 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 CD46P15529 392 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF44P15621 663 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 LTBQ06643 244 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 MPEG1Q2M385 716 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 SORCS2Q96PQ0 1159 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 A6NIN4 97 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF10CO14798 259 aa18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms