RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356537.8

CCDC25-201, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC25, Length 3,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-201ENST00000356537 RASD2Q96D21 266 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 FGF21Q9NSA1 209 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 FRG2CA6NGY1 282 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 DUX1O43812 170 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 TSPAN2O60636 221 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 HCN1O60741 890 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 BMP7P18075 431 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 RORCP51449 518 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 OR12D2P58182 307 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 MADCAM1Q13477 382 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 FAM122BQ7Z309 247 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 GID4Q8IVV7 300 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 WDFY2Q96P53 400 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 MED18Q9BUE0 208 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 MARCH7Q9H992 704 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SC5DO75845 299 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 PSKH1P11801 424 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 FOSL2P15408 326 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SKP1P63208 163 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 FAM69BQ5VUD6 431 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 RTL4Q6ZR62 310 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF550Q7Z398 422 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ACBD7Q8N6N7 88 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 MVB12AQ96EY5 273 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 NMNAT3Q96T66 252 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SLC30A2Q9BRI3 323 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF304Q9HCX3 659 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ASB6Q9NWX5 421 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 COPS3Q9UNS2 423 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 DCTN6O00399 190 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 RNF13O43567 381 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SOX30O94993 753 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SOX6P35712 828 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SPATC1Q76KD6 591 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 OR13C5Q8NGS8 318 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 HTRA1Q92743 480 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SRRQ9GZT4 340 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 KLHL1Q9NR64 748 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 HAO2Q9NYQ3 351 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 A0A1B0GX78 115 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 IRGMA1A4Y4 181 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 TMEM200CA6NKL6 621 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SNTNA6NMZ2 147 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 GPLD1P80108 840 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 NSDHLQ15738 373 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 MARCH3Q86UD3 253 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 BMPERQ8N8U9 685 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 EXD3Q8N9H8 876 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 SAP25Q8TEE9 199 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 C4orf36Q96KX1 117 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 KCTD7Q96MP8 289 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ATF6BQ99941 703 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 WWTR1Q9GZV5 400 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 PRODH2Q9UF12 536 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8.63□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 OR7A10O76100 309 aa8.62□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 UBL4AP11441 157 aa8.62□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 ABCD3P28288 659 aa8.62□□□□□ -1.03
CCDC25-201ENST00000356537 RORAP35398 523 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms