RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 EXT1Q16394 746 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PCGF3Q3KNV8 242 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 OR7E24Q6IFN5 339 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 NLRP8Q86W28 1048 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 VN1R3Q9BXE9 311 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TUBB1Q9H4B7 451 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 I3L521 148 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 LYRM1O43325 122 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 GASTP01350 101 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 DCNP07585 359 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ARSBP15848 533 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CPT1CQ8TCG5 803 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 MS4A6EQ96DS6 147 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ELOVL3Q9HB03 270 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 DAPP1Q9UN19 280 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL15A6NJ78 407 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB3DO95716 219 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CD1CP29017 333 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 FNTBP49356 437 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 AAED1Q7RTV5 226 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CMTM1Q8IZ96 169 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D15Q8TC07 691 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 GGHQ92820 318 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 STACQ99469 402 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP22Q9NRW4 184 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 USP22Q9UPT9 525 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 LAMB1P07942 1786 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CSF1P09603 554 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SSTR4P31391 388 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CCR2P41597 374 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC6A12P48065 614 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PPA1Q15181 289 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR19Q15760 415 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRED1Q7Z699 444 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 MKXQ8IYA7 352 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 APMAPQ9HDC9 416 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 REV1Q9UBZ9 1251 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CDK2P24941 298 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CD34P28906 385 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ILKQ13418 452 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC16A14Q7RTX9 510 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM178AQ8NBL3 297 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SUN5Q8TC36 379 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2S2Q9NQN1 319 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TMED7Q9Y3B3 224 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPNS1P04632 268 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 IL32P24001 234 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC16A11Q8NCK7 471 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 NDNFQ8TB73 568 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 MUCL1Q96DR8 90 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 WASH6PQ9NQA3 447 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 BMP4P12644 408 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 MSX1P28360 303 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC43A2Q8N370 569 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 M0R036 132 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 UQCRC1P31930 480 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 COX20Q5RI15 118 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC15A4Q8N697 577 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDT22Q9BRQ3 303 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL6Q9H0F7 186 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 MLXQ9UH92 298 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TP53P04637 393 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 MAOAP21397 527 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP1B3P54709 279 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TPRA1Q86W33 373 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SNAPC3Q92966 411 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGQQ9BRB3 760 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf198Q9H425 327 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PPC4 97 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TOXO94900 526 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 DDAH2O95865 285 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 AQP2P41181 271 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CYCSP99999 105 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SQSTM1Q13501 440 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 C3orf38Q5JPI3 329 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SPIN2AQ99865 258 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CTRCQ99895 268 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 LAMA4Q16363 1823 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms