RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 SSX9Q7RTT3 188 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR5H15A6NDH6 313 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR5H14A6NHG9 310 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR5H1A6NKK0 313 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SHISA7A6NL88 538 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TXNL1O43396 289 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OIP5O43482 229 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 C1orf105O95561 183 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CDK1P06493 297 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RFC3P40938 356 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TANGO2Q6ICL3 276 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FAM198BQ6UWH4 519 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR11L1Q8NGX0 322 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RAB9BQ9NP90 201 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 NGBQ9NPG2 151 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CACNA1CQ13936 2221 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 A6NIZ1 184 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 F11P03951 625 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SSR4P51571 173 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RAP1BP61224 184 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RAP1AP62834 184 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 DUSP2Q05923 314 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TANKQ92844 425 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SELENOIQ9C0D9 397 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ATP23Q9Y6H3 246 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 A3GALT2U3KPV4 340 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 GFRA2O00451 464 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MED6O75586 246 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PIPP12273 146 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OSMP13725 252 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SERPINF1P36955 418 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TFAP2CQ92754 450 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC2A13Q96QE2 648 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC2A11Q9BYW1 496 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 OR51E2Q9H255 320 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CCL26Q9Y258 94 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.87□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SOBPA7XYQ1 873 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 GABRR3A8MPY1 467 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FANCGO15287 622 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 B3GALT4O96024 378 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 EPOP01588 193 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 BRICD5Q6PL45 260 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SYT13Q7L8C5 426 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 RHEBL1Q8TAI7 183 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TXN2Q99757 166 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLIT3O75094 1523 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CLDN1O95832 211 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 AKAIN1P0CW23 69 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 BIDP55957 195 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 METTL4Q8N3J2 472 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 LUZP4Q9P127 313 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PIK3C2AO00443 1686 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 AQP9O43315 295 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 DDAH2O95865 285 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 GIFP27352 417 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 ATP4BP51164 291 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CTBSQ01459 385 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CEACAM7Q14002 265 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 MPPED2Q15777 294 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 KDM8Q8N371 416 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 GPR148Q8TDV2 347 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 SLC43A1O75387 559 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 CRYZL1O95825 349 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 FDXRP22570 491 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 TNFRSF4P43489 277 aa9.86□□□□□ -0.83
CLN8-201ENST00000331222 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms