RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 HIDE1A8MVS5 230 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 M0QZK8 103 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 GGCTO75223 188 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 GRM5P41594 1212 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TOMM20LQ6UXN7 152 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PIM3Q86V86 326 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR51A7Q8NH64 312 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CDS1Q92903 461 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ECHDC3Q96DC8 303 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CCM2Q9BSQ5 444 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 RAB18Q9NP72 206 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 EXPH5Q8NEV8 1989 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 LGI1O95970 557 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 EPHA5P54756 1037 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR9A2Q8NGT5 310 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 28.2
HDGFL3-201ENST00000299633 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OLIG2Q13516 323 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 C17orf107Q6ZR85 190 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 NUS1Q96E22 293 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 SIX2Q9NPC8 291 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 MED9Q9NWA0 146 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 COL1A2P08123 1366 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR6F1Q8NGZ6 308 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 APH1BQ8WW43 257 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CHRDQ9H2X0 955 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF320A2RRD8 509 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 STSP08842 583 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ACKR3P25106 362 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 B4GALT7Q9UBV7 327 aa10.52□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CST3P01034 146 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ACSM4P0C7M7 580 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 NID2Q14112 1375 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 B4DXG7 233 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 EFNA3P52797 238 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TAF10Q12962 218 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 IGDCC3Q8IVU1 814 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf127Q8N9H9 656 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM59LQ9UK28 342 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 FZD10Q9ULW2 581 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CLDN11O75508 207 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TUSC2O75896 110 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 GGT5P36269 586 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 GAB1Q13480 694 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ARNTL2Q8WYA1 636 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 DERAQ9Y315 318 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 C2CD4BA6NLJ0 364 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PRNPP04156 253 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 SIAH1Q8IUQ4 282 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CRLF2Q9HC73 371 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 MPGP29372 298 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 LRRC32Q14392 662 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM268Q5VZI3 342 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 NMES1Q9C002 83 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 UBE2G1P62253 170 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF763Q0D2J5 394 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PCLAFQ15004 111 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ESAMQ96AP7 390 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR51B5Q9H339 312 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CBSLP0DN79 551 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CBSP35520 551 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CHADLQ6NUI6 762 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 LPCAT3Q6P1A2 487 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 CATSPERDQ86XM0 798 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 ROS1P08922 2347 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A087X0M5 115 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1B0GX30 115 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 LALBAP00709 142 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 MPEG1Q2M385 716 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 DHRS13Q6UX07 377 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM135Q86UB9 458 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR39O43194 453 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 SYPP08247 313 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 STAG3L3P0CL85 134 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 FGF7P21781 194 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 NDUFV1P49821 464 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 OR5I1Q13606 314 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 TCTE1Q5JU00 501 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC6A19Q695T7 634 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 PGBD5Q8N414 524 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 AKR1E2Q96JD6 320 aa10.51□□□□□ -0.73
HDGFL3-201ENST00000299633 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms