RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 EMDP50402 254 aa25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 RAG2P55895 527 aa25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 RAB38P57729 211 aa25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 CDONQ4KMG0 1287 aa25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 OVCH1Q7RTY7 1134 aa25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 CSNK1A1LQ8N752 337 aa25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 PHF21AQ96BD5 680 aa25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 PELI1Q96FA3 418 aa25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 SIPA1Q96FS4 1042 aa25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 CMTM3Q96MX0 182 aa25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 EVA1BQ9NVM1 165 aa25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 CAMK2AQ9UQM7 478 aa25.76■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 LRRN3E7EW58 273 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF10AO00220 468 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 TFP02787 698 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 SRP54P61011 504 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 SIRPAP78324 504 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 CCDC58Q4VC31 144 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 ULK3Q6PHR2 472 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 ZNF550Q7Z398 422 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 TTC9Q92623 222 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 FANCMQ8IYD8 2048 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 A0A0J9YY10 115 aa25.75■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 SHISA5Q8N114 240 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 RFLNBQ8N5W9 214 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 SPATA2Q9UM82 520 aa25.75■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 MYO9BQ13459 2157 aa25.74■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa25.74■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 OR10H2O60403 315 aa25.74■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 SIAH3Q8IW03 269 aa25.74■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 SLC35F2Q8IXU6 374 aa25.74■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 SDR9C7Q8NEX9 313 aa25.74■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 PHYHIPQ92561 330 aa25.74■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 GPR143P51810 404 aa25.73■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 ALG11Q2TAA5 492 aa25.73■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 SLC22A10Q63ZE4 541 aa25.73■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 OR11H7Q8NGC8 314 aa25.73■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 OR4K13Q8NH42 304 aa25.73■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 OR14A16Q8NHC5 309 aa25.73■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 SNX33Q8WV41 574 aa25.73■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 CACNG6Q9BXT2 260 aa25.73■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 NRIP3Q9NQ35 241 aa25.73■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa25.73■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 CDH24Q86UP0 819 aa25.72■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 SGTBQ96EQ0 304 aa25.72■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 CAPN10Q9HC96 672 aa25.72■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 RNF215Q9Y6U7 377 aa25.72■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 CEP290O15078 2479 aa25.72■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 GIFP27352 417 aa25.72■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 ZNF141Q15928 474 aa25.72■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 ARL14Q8N4G2 192 aa25.72■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 GPR137Q96N19 417 aa25.72■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 ZFP3Q96NJ6 502 aa25.72■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa25.72■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa25.71■■□□□ 1.71
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UBP1-201ENST00000283628 YPEL5P62699 121 aa25.71■■□□□ 1.71
UBP1-201ENST00000283628 UBE2NLQ5JXB2 153 aa25.71■■□□□ 1.71
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