RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 WNT2BQ93097 391 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 FBXO17Q96EF6 278 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 WNT5BQ9H1J7 359 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 CHST10O43529 356 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 SNX33Q8WV41 574 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 OSTF1Q92882 214 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 FGF11Q92914 225 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 HS6ST2Q96MM7 605 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ZFP3Q96NJ6 502 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 NTMT1Q9BV86 223 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 TOLLIPQ9H0E2 274 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 KCND3Q9UK17 655 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 PCDH7O60245 1069 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ZNF35P13682 527 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 PRPS1L1P21108 318 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 BDKRB2P30411 391 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 MECP2P51608 486 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 SFXN4Q6P4A7 337 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 OR2W3Q7Z3T1 314 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ASB16Q96NS5 453 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 SOX7Q9BT81 388 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 RDH14Q9HBH5 336 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 HRASLSQ9HDD0 168 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 SMCO4Q9NRQ5 59 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX1-201ENST00000265340 NPIPB9F8W1W9 429 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 GNSP15586 552 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 NFYBP25208 207 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 GDNFP39905 211 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 DPPA2Q7Z7J5 298 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 SMIM4Q8WVI0 70 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 SLAMF9Q96A28 289 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 MYADMQ96S97 322 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 TMEM202A6NGA9 273 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 FAM227AF5H4B4 570 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 ACHEP22303 614 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 PRPH2P23942 346 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 PMELP40967 661 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 RPIAP49247 311 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 AKR1C2P52895 323 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 AKR1C1Q04828 323 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 SLC29A4Q7RTT9 530 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 CLECL1Q8IZS7 167 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 OR5J2Q8NH18 312 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 PIGKQ92643 395 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 NOX3Q9HBY0 568 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 OR2AG2A6NM03 316 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 F5H5P2 479 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 F12P00748 615 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 EPORP19235 508 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 SDHAP31040 664 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 DPPA4Q7L190 304 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 OR8J2Q8NGG1 315 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 UBTD2Q8WUN7 234 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 OR1F2PQ96R84 312 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 GFOD1Q9NXC2 390 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 KLHL42Q9P2K6 505 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 CAMK2AQ9UQM7 478 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 SPINT1O43278 529 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 PRMT3O60678 531 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 OR12D1P0DN82 309 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 APEHP13798 732 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 NUDT13Q86X67 352 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 ZNF383Q8NA42 475 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 HIST1H2BAQ96A08 127 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 CMTM7Q96FZ5 175 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 ARL15Q9NXU5 204 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 A0A0D9SG52 128 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 C1orf226A1L170 272 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 NUDT19A8MXV4 375 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 AP4M1O00189 453 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 PRODHO43272 600 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 RAB4AP20338 218 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 RAB5CP51148 216 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 H2BFSP57053 126 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 PPA1Q15181 289 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 ASB11Q8WXH4 323 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX1-201ENST00000265340 SMARCD2Q92925 531 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms