RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 PXKQ7Z7A4 578 aa23.48■■□□□ 1.35
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RAB40C-201ENST00000248139 DEDD2Q8WXF8 326 aa23.48■■□□□ 1.35
RAB40C-201ENST00000248139 BEX1Q9HBH7 125 aa23.48■■□□□ 1.35
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RAB40C-201ENST00000248139 ANKRD34CP0C6C1 535 aa23.44■■□□□ 1.34
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RAB40C-201ENST00000248139 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CEP78Q5JTW2 689 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 C14orf105Q9NVL8 296 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ACOD1A6NK06 481 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 B4DGG1 531 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 TNFRSF10CO14798 259 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 AK1P00568 194 aa23.44■■□□□ 1.34
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