RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OAFQ86UD1 273 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SLC34A3Q8N130 599 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SLC15A4Q8N697 577 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OR52N1Q8NH53 320 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 METTL21AQ8WXB1 218 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SLC39A7Q92504 469 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 TAPBPLQ9BX59 468 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ADAM19Q9H013 955 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 EGLN3Q9H6Z9 239 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 WDR54Q9H977 334 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 FLRT3Q9NZU0 649 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 IL17BQ9UHF5 180 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF337Q9Y3M9 751 aa9.76□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC88CQ9P219 2028 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 A0A075B6Q4 140 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CLDN25C9JDP6 229 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 K7EM74 188 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 MYL12BO14950 172 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PTHP01270 115 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 IGHA1P01876 353 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ZGLP1P0C6A0 271 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF12P17014 697 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SOX6P35712 828 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SLC1A3P43003 542 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 HTR3AP46098 478 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 NUDT6P53370 316 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CDH11P55287 796 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 DLX5P56178 289 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 WNT4P56705 351 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 IL10RAQ13651 578 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SPCS2Q15005 226 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 MED22Q15528 200 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 TRAM1Q15629 374 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 EMC4Q5J8M3 183 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 LCN10Q6JVE6 187 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 NLGN4XQ8N0W4 816 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 OR8D4Q8NGM9 314 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 STT3BQ8TCJ2 826 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 NKD1Q969G9 470 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SGTBQ96EQ0 304 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SAMD8Q96LT4 415 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CTPS2Q9NRF8 586 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CNIH4Q9P003 139 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 J3QRE1 110 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 HRKO00198 91 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CDC42EP2O14613 210 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 SCRG1O75711 98 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 UTS2O95399 124 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 CD1AP06126 327 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 HEXBP07686 556 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 TSPAN19P0C672 248 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 LIFP15018 202 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 FUT1P19526 365 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 PGCP20142 388 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 MAKP20794 623 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 MSX1P28360 303 aa9.74□□□□□ -0.85
CDCA3-201ENST00000229265 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms