RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 GINS1Q14691 196 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf141Q5SZD1 244 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 BROXQ5VW32 411 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 ARSKQ6UWY0 536 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 EML6Q6ZMW3 1958 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRG3Q86Y34 549 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT16Q8N428 558 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX47Q8TBZ9 253 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 OSTF1Q92882 214 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 SGTBQ96EQ0 304 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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CAPNS1-215ENST00000628018 WASF3Q9UPY6 502 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 SAGP10523 405 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKAR1AP10644 381 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 FXYD6P3P58550 94 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A53Q5H9E4 307 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCZ1Q86YW0 608 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 CNIH3Q8TBE1 160 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF226Q9NYT6 803 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXL2Q9UKC9 423 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 SIGLEC7Q9Y286 467 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 TMED7Q9Y3B3 224 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 PTP4A3O75365 173 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX4O95219 450 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 GABRB1P18505 474 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 SPINK2P20155 84 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 IQCF1Q8N6M8 205 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 OR13C2Q8NGS9 318 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 RHOXF1Q8NHV9 184 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM41AQ96HV5 264 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 NPAS1Q99742 590 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 SCNM1Q9BWG6 230 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 RASSF1Q9NS23 344 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 SACM1LQ9NTJ5 587 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 ABI3Q9P2A4 366 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 AASSQ9UDR5 926 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 VDAC3Q9Y277 283 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM64A6NGJ6 449 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SNPHO15079 494 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 P04436 131 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CD96P40200 585 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SMSP52788 366 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 FHL1Q13642 323 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 PLPPR5Q32ZL2 321 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD21Q4G0X4 260 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSM5Q6NUN0 579 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC27A4Q6P1M0 643 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 POMZP3Q6PJE2 187 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 PSD4Q8NDX1 1056 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4K17Q8NGC6 315 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 APH1BQ8WW43 257 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 LIPHQ8WWY8 451 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TSSK6Q9BXA6 273 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52D1Q9H346 318 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 PTGES2Q9H7Z7 377 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D23Q9NUY8 699 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 IMPAD1Q9NX62 359 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM72A0PK05 275 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK2AP1O14519 115 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SUSD5O60279 629 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 WBP4O75554 376 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 OR7A10O76100 309 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNA2P20248 432 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC9A3P48764 834 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBA3CQ13748 450 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBA3EQ6PEY2 450 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 OAFQ86UD1 273 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 FANK1Q8TC84 345 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 MRGPRX4Q96LA9 322 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMD8Q96LT4 415 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 LRFN1Q9P244 771 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SCOCQ9UIL1 159 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRN3E7EW58 273 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 HCN1O60741 890 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 NPIPB7O75200 414 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 RCBTB2O95199 551 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CH25HO95992 272 aa22.56■■□□□ 1.2
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CAPNS1-215ENST00000628018 FOXF1Q12946 379 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF74Q16587 644 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBED5Q49AG3 693 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM154Q6P9G4 183 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SMARCD3Q6STE5 483 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 CASP12Q6UXS9 341 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF11Q92914 225 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF566Q969W8 418 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-215ENST00000628018 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
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