RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PGAP1	Q75T13	922 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PAQR7	Q86WK9	346 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LNX2	Q8N448	690 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	BMPER	Q8N8U9	685 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	HGD	Q93099	445 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TSLP	Q969D9	159 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TSSK3	Q96PN8	268 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SGPP1	Q9BX95	441 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NOTCH2	Q04721	2471 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	C4orf51	C9J302	202 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OR7A17	O14581	309 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC16A5	O15375	505 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC22B	O75396	215 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OTC	P00480	354 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PDYN	P01213	254 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CELA2A	P08217	269 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FURIN	P09958	794 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RAP2A	P10114	183 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	COX5B	P10606	129 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ITGA3	P26006	1051 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TGM4	P49221	684 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CASP9	P55211	416 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KEAP1	Q14145	624 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TIGD6	Q17RP2	521 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2T4	Q8NH00	348 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		6.69	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GX78	115 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PS29	197 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM20B	O75063	409 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MPC2	O95563	127 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-DQB1	P01920	261 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ANXA3	P12429	323 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RAC2	P15153	192 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB3B	P20337	219 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	BTG1	P62324	171 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	IL11RA	Q14626	422 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FRG2	Q64ET8	278 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	VASN	Q6EMK4	673 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LCTL	Q6UWM7	567 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CUZD1	Q86UP6	607 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OTULIN	Q96BN8	352 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LURAP1	Q96LR2	239 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FRG2B	Q96QU4	278 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NEU1	Q99519	415 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF32	Q9H0A6	362 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NT5DC2	Q9H857	520 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GV90	55 aa		6.68	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM74A7	A6NL05	159 aa		6.68	□□□□□ -1.34

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