RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 CXCR2P25025 360 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4D-210ENST00000588972 MPGP29372 298 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4D-210ENST00000588972 KLC1Q07866 573 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4D-210ENST00000588972 TRAF3Q13114 568 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4D-210ENST00000588972 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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ATG4D-210ENST00000588972 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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ATG4D-210ENST00000588972 DCST1Q5T197 706 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4D-210ENST00000588972 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.96□□□□□ -1.3
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ATG4D-210ENST00000588972 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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ATG4D-210ENST00000588972 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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ATG4D-210ENST00000588972 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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ATG4D-210ENST00000588972 F2RL3Q96RI0 385 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4D-210ENST00000588972 SMC6Q96SB8 1091 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4D-210ENST00000588972 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ATG4D-210ENST00000588972 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4D-210ENST00000588972 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4D-210ENST00000588972 MS4A8Q9BY19 250 aa6.95□□□□□ -1.3
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