RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555905.5

TMEM260-208, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 5

Gene TMEM260, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-208ENST00000555905 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 PRSS27Q9BQR3 290 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 PIGQQ9BRB3 760 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 FUZQ9BT04 418 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 SLC19A3Q9BZV2 496 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 KLHL4Q9C0H6 718 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ADNPQ9H2P0 1102 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ZNF556Q9HAH1 456 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 TUBD1Q9UJT1 453 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 OSGIN1Q9UJX0 560 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 TMED7Q9Y3B3 224 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 MED31Q9Y3C7 131 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 LOC400499M0QZD8 3231 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 CHD8Q9HCK8 2581 aa10□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 A0A087WUU8 490 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 FAM166BA8MTA8 275 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 PDLIM1O00151 329 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 SUSD5O60279 629 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ZIC3O60481 467 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 RASAL1O95294 804 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 NTN1O95631 604 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 PDGFAP04085 211 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 RFPL3SP0C7P2 107 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 FAM87AP0C7U9 286 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ANXA8P13928 327 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 CCNA2P20248 432 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 PRKACGP22612 351 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 VHLP40337 213 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 RFC3P40938 356 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 FOXK2Q01167 660 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 HYAL4Q2M3T9 481 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 TBPL2Q6SJ96 375 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 WDR88Q6ZMY6 472 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 Q6ZS92 163 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ADGRG3Q86Y34 549 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 NRMQ8IXM6 262 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 NRG4Q8WWG1 115 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 FEVQ99581 238 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 PSD2Q9BQI7 771 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ZNF426Q9BUY5 554 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 OR2B2Q9GZK3 357 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 UBQLN3Q9H347 655 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 PRORYQ9H606 182 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 NCKAP5O14513 1909 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 HTR3EA5X5Y0 456 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 A8MVM7 634 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 K7EM74 188 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 SOCS2O14508 198 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 EI24O14681 340 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ZNF208O43345 1280 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 HPRP00739 348 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ADAP00813 363 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 HPNP05981 417 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 PTNP21246 168 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ELK4P28324 431 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 MAGEA5P43359 124 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 ALDH3A2P51648 485 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 UGT2B15P54855 530 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 PRKCDQ05655 676 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 SELENBP1Q13228 472 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 DAG1Q14118 895 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 LINC00303Q3SY05 128 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 FAM109AQ8N4B1 249 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 TMEM251Q8N6I4 163 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 OR9Q2Q8NGE9 314 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 OR5M1Q8NGP8 315 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 POC1BQ8TC44 478 aa9.98□□□□□ -0.81
TMEM260-208ENST00000555905 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms