RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533051.5

SLC43A3-222, Transcript of solute carrier family 43 member 3, human

TSL 2

Gene SLC43A3, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF550	Q7Z398	422 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	RETREG3	Q86VR2	466 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	LILRA2	Q8N149	483 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	HIPK4	Q8NE63	616 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	LRRC58	Q96CX6	371 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	PINK1	Q9BXM7	581 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CLDN24	A6NM45	220 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051		B4DXG7	233 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	AIM2	O14862	343 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	OIP5	O43482	229 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	DCTN3	O75935	186 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	OPN1LW	P04000	364 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	TFPI	P10646	304 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	FCGR2A	P12318	317 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	COX4I1	P13073	169 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	PRKCA	P17252	672 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	AQP1	P29972	269 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	TIMP3	P35625	211 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	HTR3A	P46098	478 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	NCALD	P61601	193 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	SELENBP1	Q13228	472 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	HBM	Q6B0K9	141 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	RTL6	Q6ICC9	239 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	VRK2	Q86Y07	508 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	OR10A6	Q8NH74	314 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	WNT2B	Q93097	391 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	KLHL15	Q96M94	604 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ACER3	Q9NUN7	267 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	GMEB1	Q9Y692	573 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	NCKAP5	O14513	1909 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	FBP2	O00757	339 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	TNFSF11	O14788	317 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	BMP5	P22003	454 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	OPRM1	P35372	400 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CLDN20	P56880	219 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CARD18	P57730	90 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	SESN3	P58005	492 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	POU4F3	Q15319	338 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	RNF220	Q5VTB9	566 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	GRINA	Q7Z429	371 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	SERPINA11	Q86U17	422 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CADM2	Q8N3J6	435 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	RCN3	Q96D15	328 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	PIF1	Q9H611	641 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	NANOG	Q9H9S0	305 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	SELENON	Q9NZV5	590 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	FREM3	P0C091	2139 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	CDHR4	A6H8M9	788 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	NDUFAB1	O14561	156 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SLC43A3-222	ENST00000533051	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms