RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520348.5

SNHG6-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG6, Length 648 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG6-201ENST00000520348 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PTPRBP23467 1997 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TP53I11O14683 189 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PRKYO43930 277 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FAM20BO75063 409 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 FZD7O75084 574 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 OR7A10O76100 309 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 GP1BBP13224 206 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PTNP21246 168 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PCMT1P22061 227 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CASP3P42574 277 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 HTR3AP46098 478 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF74Q16587 644 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ANKDD1AQ495B1 522 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ZBED5Q49AG3 693 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 XAF1Q6GPH4 301 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SLC30A6Q6NXT4 461 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF563Q8TA94 476 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM163Q8TC26 289 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 RNF217Q8TC41 542 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PSMF1Q92530 271 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SAMD8Q96LT4 415 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 Q96MT0 163 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 PHOX2BQ99453 314 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 CLN6Q9NWW5 311 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 KNTC1P50748 2209 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF292O60281 2723 aa14.58□□□□□ -0.07
SNHG6-201ENST00000520348 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 CLCA1A8K7I4 914 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 SURF4O15260 269 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 HMGN1P05114 100 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 PRKCAP17252 672 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 FUT1P19526 365 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 SATL1Q86VE3 508 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 OR6S1Q8NH40 331 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ASB15Q8WXK1 588 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM234Q8WY98 164 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 GGHQ92820 318 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 FN3KQ9H479 309 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.58□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 RGS10O43665 173 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ENTPD6O75354 484 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 BMP7P18075 431 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ITPKBP27987 946 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 MVKQ03426 396 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ATP1A4Q13733 1029 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 IRF3Q14653 427 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 SYT14P1Q58G82 188 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 BICRALQ6AI39 1079 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 OAFQ86UD1 273 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ADGRG3Q86Y34 549 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 OR2M3Q8NG83 312 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 STK35Q8TDR2 534 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 MUL1Q969V5 352 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 SGCZQ96LD1 299 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.57□□□□□ -0.08
SNHG6-201ENST00000520348 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms